XPC与RAD23B或RAD23A和CETN2结合,采用两阶段的过程来识别扭曲的DNA螺旋。在第一阶段,XPC快速探测dsDNA,这是由位于XPC DNA结合区域附近的带负电荷的beta-turn延伸的DNA排斥作用促进的。在第二阶段,DNA结合区域由两个发夹组成,结合dsDNA中的非氢键碱基(Camenisch et al. 2009)。Rad4是XPC的酵母同源物,可以识别热动力学破坏正常沃森-克里克碱基配对的病变。Rad4在DNA双螺旋结构中插入一个β发夹,导致受损的碱基对从双螺旋结构中翻转出来。Rad4与未受损的DNA链结合,而含有受损核苷酸的DNA链则发生扭曲(Min和Pavletich 2007)。
在DDB1:DDB2复合物(也称为UV-DDB复合物)存在时,XPC:RAD23:CETN2复合物与扭曲的DNA的结合增强。UV-DDB复合物优先结合紫外线产生的损伤,如嘧啶-嘧啶酮光二聚体(6-4 PPDs)和环丁烷嘧啶二聚体(CPDs),但也识别无嘌呤/嘧啶(AP)位点和2-3 bp错配的DNA (Fujiwara et al. 1999, Wittschieben et al. 2005)。UV-DDB复合物的DDB2亚基是一个WD40重复beta螺旋桨蛋白。DDB2的β -螺旋桨结构域与受损的DNA链结合(Scrima et al. 2008)。UV-DDB复合物是一个更大的泛素连接酶复合物的一部分,除了DDB1和DDB2外,还包含CUL4A或CUL4B和RBX1 (Groisman et al. 2003, Sugasawa et al. 2005)。在6-4 PPDs和CPDs的情况下,UV-DDB与受损DNA的结合可能先于XPC:RAD23:CETN2复合物的结合。然而,在6 - 4产后抑郁症,XPC: RAD23: CETN2复杂也可以识别受损的DNA没有UV-DDB复杂(惠誉et al . 2003年,莫泽et al . 2005年,王et al . 2004),但保留的UV-DDB复杂可能是重要的DNA修复蛋白在DNA损伤部位(哦et al . 2011年)。
Ino80染色质重塑复合物可正常调节GG-ner。INO80和ACTR5(ARP5)亚o80复合物的亚基在GG-NER网站上富集,可能是通过与DDB1的相互作用。在DNA损伤部位的INO80复合物的染色质弛豫可能是XPC招聘所必需的(江等人。2010)。在酵母中,据报道,InO80与XPC和Rad23之间的邻接之间的相互作用,并且建议该相互作用对于染色质结构恢复至关重要(Sarkar等,2010)。