蛋白多糖是细胞外基质的主要成分。在软骨中,基质构成超过90%的组织干重。蛋白质聚糖是用糖胺聚糖(GAG)取代的蛋白质,由重复二糖组成的线性多糖,通常是乙酰化氨基糖交替的
用尿酸酸。大多数蛋白质聚糖位于细胞外
空间。蛋白质聚糖是高度多样的,无论是核心蛋白质和GAG链的亚型,即硫酸软骨素(CS),角蛋白硫酸盐(Ks),皮肤硫酸盐硫酸盐(DS)和硫酸乙酰肝素(HS)都是多样化的。透明质酸是一种非硫酸化的GAG,其分子量为数百万的道尔顿;在关节软骨中,单个透明质酸分子可容纳100至100个噬菌体分子,并且这些聚集体通过链路蛋白稳定。