抗原呈递细胞(APCs),如B细胞、树突状细胞(dc)和单核/巨噬细胞(单核/巨噬细胞)在其表面表达主要组织相容性复合体II类分子(MHC II),并向CD4+ T辅助细胞提供外源性抗原肽。CD4+ T细胞在免疫保护中起着核心作用。在激活它们时,它们刺激B细胞分化为产生抗体的B细胞母细胞,并启动适应性免疫反应。MHC II类分子是-和-亚基跨膜糖蛋白异二聚体。内质网中新合成的MHC II分子与一个称为不变(II)链的伴侣蛋白结合。Ii的结合阻止了自身抗原与ER中新生MHC分子的过早结合,也引导MHC分子进入内吞噬室。在酸性内体环境中,Ii被逐步降解,最终释放Ii类肽结合槽,用于装载抗原肽。外源性抗原通过受体介导的内吞作用、吞噬作用或胞饮作用被APC内化到MHC II类阳性细胞的内吞室中,被吞噬的抗原在低pH环境下被多种酸性蛋白酶降解,生成MHC II类抗原表位。然后抗原肽被装载到II类配体结合槽中。产生的II类肽复合物然后移动到细胞表面,在那里它们被CD4+ T细胞扫描以进行特异性识别(Berger & Roche 2009, Zhou & Blum 2004, Watts 2004, Landsverk et al. 2009)。