到目前为止,我们已经放置了现有的常规通路图和教科书风格的插图在我们的途径详细页面(例如止血那血小板粘附到暴露胶原蛋白),将单一反应作为唯一没有自包含图像的事件类型。为了填充间隙,已经开发了一种自动算法来确定局限性反应。它直接使用我们的数据图表数据库在没有任何人的干预的情况下生成图像。
长话短说,算法的策略在左侧的输入,右侧的输出,顶部的催化剂和底部的稳压器。每个元素都放置在其相应的隔间中,并且这些元素嵌套在后面基因本体层次结构。该算法支持正常和疾病*反应最小化空间以及避免线以跨越显示器中的不必要元素。
最后,反应可视化符合系统生物学图形符号(SBGN)。
一些例子:
*疾病反应可以被归类为传染性,职能增益或丢失的功能。在后一种类别中,一些参与者必须被勾出出来。