bioax pathway由Reactome数据库中“DHAP is convert to G3P by GPD1/GPD1L”转化而来。 从左到右 1.1.1.8 DHAP通过GPD1/GPD1L转换为G3P 磷酸二羟基丙酮转化为甘油-3-磷酸 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp DHAP glycerone磷酸 二羟丙酮磷酸 glycerone磷酸(2 -) Reactome DB_ID: 75970 胞质 基因本体论 去:0005829 glycerone磷酸(2 -)(ChEBI: 57642) glycerone磷酸(2 -) 二羟丙酮磷酸二阶阴离子 glycerone磷酸二阶阴离子 二羟丙酮磷酸 3-hydroxy-2-oxopropyl磷酸 ChEBI CHEBI: 57642 Reactome数据库ID Release 77 75970 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=75970 Reactome r - - 75970 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-75970.4 Reactome //www.joaskin.com 复合 C00111 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 NADH Reactome DB_ID: 73473 NADH (2 -) (ChEBI: 57945) NADH (2 -) NADH二阶阴离子 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoyl-1 4-dihydropyridin-1-yl) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl]二磷酸} NADH ChEBI CHEBI: 57945 Reactome数据库ID Release 77 73473 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=73473 Reactome r - - 73473 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-73473.4 复合 C00004 H + 质子 海昌 Reactome DB_ID: 70106 海昌(ChEBI: 15378) 海昌 ChEBI CHEBI: 15378 Reactome数据库ID Release 77 70106 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=70106 Reactome r - - 70106 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-70106.4 复合 C00080 G3P Glycerol-3-phosphate sn-glycerol -磷酸 Reactome DB_ID: 76114 sn-glycerol 3 -磷酸(ChEBI: 15978) sn-glycerol -磷酸 ChEBI CHEBI: 15978 Reactome数据库ID Release 77 76114 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=76114 Reactome r - - 76114 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-76114.3 复合 C00093 河畔 NAD + NAD (+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 DPN Diphosphopyridine核苷酸 Reactome DB_ID: 29360 NAD (1 -) (ChEBI: 57540) NAD (1 -) 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoylpyridinio) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl)二磷酸} NAD (+) NAD阴离子 ChEBI CHEBI: 57540 Reactome数据库ID Release 77 29360 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29360 Reactome r - - 29360 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29360.5 复合 C00003 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 GPD1 / GPD1L为 Reactome DB_ID: 9960184 GPD1二聚体 Reactome DB_ID: 9960176 GPD1 GPD1 F1P976 Reactome DB_ID: 9960174 UniProt: F1P976 GPD1 犬属后裔 NCBI分类法 9615 UniProt F1P976 2 平等的 349 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9960174 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960174 Reactome r - cfa - 55875 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-55875.1 2 Reactome数据库ID Release 77 9960176 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960176 Reactome r - cfa - 76117 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-76117.1 GPD1L二聚体 Reactome DB_ID: 9960182 GPD1L GPD1L A0A5F4CTG5 Reactome DB_ID: 9960180 UniProt: A0A5F4CTG5 GPD1L UniProt A0A5F4CTG5 1 平等的 351 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9960180 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960180 Reactome r - cfa - 1498784 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-1498784.1 2 Reactome数据库ID Release 77 9960182 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960182 Reactome r - cfa - 1500615 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-1500615.1 Reactome数据库ID Release 77 9960184 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960184 Reactome r - cfa - 1500610 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-1500610.1 基因本体论 去:0004367 细胞功能的基因本体论术语 心肌梗死 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID Release 77 9960185 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960185 Reactome数据库ID Release 77 9960187 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9960187 Reactome r - cfa - 75889 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-75889.1 二羟基丙酮磷酸(DHAP)通过甘油-3-磷酸脱氢酶(GPD1)或类甘油-3-磷酸脱氢酶(GPD1L)转化为甘油-3-磷酸(G3P) (Ou et al. 2006, Valdivia et al. 2009)。这两种酶的活性形式都是同型二聚体。这种反应可能在甘油-3-激酶活性不足够的白色脂肪组织中发现。GPD1/GPD1L通过NADH提供电子来还原二羟基丙酮磷酸。 16460752 Pubmed 2006 人甘油3-磷酸脱氢酶1 (GPD1)晶体结构 或者,X 霁,C 汉族,X 赵,小东 李,X 毛,Y 黄,你 Bartlam,马克 Rao Zihe 中华医学杂志(英文版 19666841 Pubmed 2009 GPD1L通过pkc依赖的钠通道SCN5A磷酸化将氧化还原状态与心脏兴奋性联系起来 瓦尔迪维亚、铬 建筑师,K 阿克曼,迈克尔J Makielski, JC Am J Physiol Heart Circ Physiol 297:H1446-52 从电子注释推断 证据的代码 生态:0000203