在Reactome数据库中,BioPAX途径由“sabob:Mn2+转移Gal到H抗原sec形成B抗原”转化而来。
从左到右
2.4.1.37
sabob:Mn2+将Gal转移到H抗原-sec形成B抗原
作为高尔基体膜的居民,组织血型ABO系统转移酶(ABO)可以被未知蛋白酶水解成可溶性形式,岩藻糖基糖蛋白α-N-乙酰半乳糖胺基转移酶(sABO)。A、 B和AB个体表达糖基转移酶活性,将H抗原转化为A抗原(通过添加GalNAc)、B抗原(通过添加Gal)或AB抗原(通过添加GalNAc和Gal)。O集体和个人缺乏这种活动。四种关键氨基酸(176、235、266和268)的差异改变了A到B糖基转移酶的特异性(Yamamoto等人,1990年,Yamamoto&McNeill 1996年,Seto等人,1999年,Alfaro等人,2008年)。组织血型B转移酶(sABO-B)的可溶性形式利用UDP-半乳糖(Gal)将半乳糖(Gal)转移到通过1型链形成的H抗原,从而在分泌子中形成B抗原(B抗原sec)(Patenaude等人,2002年,Persson等人,2007年)。
作者:Jassal, Bijay, 2018-01-02
评论:松井,Taei, 2018-12-17
编辑:Jassal, Bijay, 2018-01-02
O抗原
H antigen-sec
alpha-L-Fuc - (1 - > 2) -beta-D-Gal (1 - > 3) -beta-D-GalNAc - (1 - > 3) -alpha-D-Gal-yl组
R-alpha-D-Gal-beta1、3-alpha-D-GlcNAc-beta1 3-D-Gal-alpha1 2-Fuc
R-alpha-D-Gal - (1,3) -alpha-D-GlcNAc - (1,3) -D-Gal -alpha-D-Fuc(1、2)
alpha-L-Fuc - (1 - > 2) -beta-D-Gal (1 - > 3) -beta-D-GlcNAc - (1 - > 3) -alpha-D-Gal-yl组
反应数据库ID:9034101
细胞外区域
基因本体论
去:0005576
α-L-Fuc-(1->2)-β-D-Gal-(1->3)-β-D-GlcNAc-(1->3)-α-D-Gal-yl基团[ChEBI:140180]
alpha-L-Fuc - (1 - > 2) -beta-D-Gal (1 - > 3) -beta-D-GlcNAc - (1 - > 3) -alpha-D-Gal-yl组
ChEBI
CHEBI: 140180
Reactome数据库ID Release 77
9034101
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Reactome
R-ALL-9034101
1
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Reactome
//www.joaskin.com
UDP-Gal
UDPG半乳糖
UDP-D-半乳糖
UDP-D-galactopyranose
反应数据库ID:9034065
UDP-D-半乳糖[ChEBI:18307]
UDP-D-半乳糖
UDPG半乳糖
UDP-D-galactopyranose
ChEBI
车比:18307
Reactome数据库ID Release 77
9034065
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Reactome
R-ALL-9034065
1
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复合
C00052
额外的信息
心肌梗死
小姐:0361
B antigen-sec
α-D-半乳糖-(1->3)-(α-L-岩藻糖-(1->2)]-β-D-半乳糖-(1->3)-β-D-半乳糖-(1->3)-α-D-半乳糖基
R-alpha-D-Gal-beta1、3-alpha-D-GlcNAc-beta1 3-D-Gal -(α1,2-Fuc)阿尔法1,3-Gal
α-L-岩藻糖-(1->2)-[α-D-半乳糖-(1->3)]-β-D-半乳糖-(1->3)-β-D-半乳糖-(1->3)-α-D-半乳糖基
Reactome DB_ID: 9037067
alpha-L-Fuc - (1 - > 2) [alpha-D-Gal - (1 - > 3)] -beta-D-Gal - (1 - > 3) -beta-D-GlcNAc (1 - > 3) -alpha-D-Gal-yl集团(ChEBI: 140187)
α-L-岩藻糖-(1->2)-[α-D-半乳糖-(1->3)]-β-D-半乳糖-(1->3)-β-D-半乳糖-(1->3)-α-D-半乳糖基
ChEBI
CHEBI: 140187
Reactome数据库ID Release 77
9037067
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Reactome
r - - 9037067
1
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UDP
尿苷5 '磷酸氢盐
Reactome DB_ID: 417888
UDP[ChEBI:17659]
UDP
ChEBI
CHEBI: 17659
Reactome数据库ID Release 77
417888
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Reactome
r - - 417888
2
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复合
C00015
激活
sABO-B:Mn2+
Reactome DB_ID: 9034031
sABO-B
可溶性组织血型ABO系统B转移酶
BGAT_HUMAN
Reactome DB_ID: 9034076
UniProt: P16442 ABO血型
土著居民的
功能该蛋白是ABO血型系统的基础。组织血型ABO涉及三种碳水化合物抗原:A、B和H。A、B和AB个体表达糖基转移酶活性,将H抗原转化为A抗原(通过添加UDP-GalNAc)或B抗原(通过添加UDP-Gal),而O个体缺乏这种活性。途径蛋白修饰;蛋白质糖基化结构域保守的DXD基序参与辅因子结合。锰离子与UDP的β-磷酸基团相互作用,也可能在催化作用中发挥作用。PTM可溶性形式通过蛋白水解过程从膜形式衍生而来。ABO的多态性遗传变异定义了ABO血型系统[MIM:616093]。ABO血型系统是输血中最重要的血型系统。这里显示的序列是转移酶的序列。B型因几个残基取代而不同。残基266和268对特异性很重要。参考基因组组合(GRCh38/hg38)描述了一个非功能性O型ABO等位基因。O型ABO等位基因导致鸟嘌呤缺失(NM_020469.2:c.286delG)。这种缺失导致移码并产生过早终止密码子,导致截短的(117个氨基酸)蛋白质失去任何糖基转移酶活性(PubMed:2333095)。相似性属于糖基转移酶6家族。
智人
NCBI分类法
9606
UniProt
P16442
176
相同的
除精氨酸
摩登派青年
国防部:01632
235
相同的
除甘氨酸
摩登派青年
国防部:01638
266
相同的
L-leucine删除
摩登派青年
国防部:01641
268
相同的
54
相同的
354
相同的
Reactome数据库ID Release 77
9034076
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9034076
Reactome
r - hsa - 9034076
1
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1
Mn2 +
锰
锰(2 +)
锰(II)
Reactome DB_ID: 266099
锰(2 +)(ChEBI: 29035)
锰(2 +)
Mn (2 +)
锰(II)离子
锰离子(Mn2+)
锰(II)
锰离子
ChEBI
CHEBI: 29035
Reactome数据库ID Release 77
266099
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Reactome
r - - 266099
3.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-266099.3
复合
C00034
1
Reactome数据库ID Release 77
9034031
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Reactome
R-HSA-9034031
1
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基因本体论
去:0004381
细胞功能的基因本体论术语
心肌梗死
小姐:0355
相同的催化剂活性
Reactome数据库ID Release 77
9034038
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Reactome数据库ID Release 77
9034053
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Reactome
r - hsa - 9034053
1
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