从“Calpain 1或Calpain 2或Calpain 2切换CDK5R1(P35)”转换的BIoPAX路径在反应数据库中。
左到右
calpain1或calpain2切割Cdk5r1 (p35)
在小鼠脑中,神经毒性诱导神经元细胞钙(CA2 +)水平的增加,触发CALPAIN活化和CALPAIN介导的P35(CDK5R1)的切割,以产生细胞溶质P25片段(LEE等人2000)。小鼠CDK5R1显示对人矫正物的98%序列同一性,并且在两个物种之间也高度保守钙PAIN复合亚基。在神经元,CAPN1(MU-CALPAIN)和CAPN2(M-CALPAIN)中表达的两个CALPAIN催化亚基分别为人类对应的89%和94%。调节亚基CAPNS1和CAPNS2分别与人蛋白相同的94%和92%。
撰写:Shah,Kavita,2016-02-23
编辑:Orlic-Milacic, Marija, 2016-05-10
MYRG-P35.
MYRG-CDK5R1(2-307)
反应DB_ID:8863426
血浆膜
基因本体论
去:0005886.
UNIPROT:P61809 CDK5R1
CDK5R1
CDK5R.
nck5a.
FUNCTION p35是CDK5的神经元特异性激活物。复杂的p35/CDK5对于神经突的生长和皮质层积是必需的。通过介导EFNA1-EPHA4信号通路参与树突棘形态形成。TPKII活化剂。复合物p35/CDK5通过调节clock蛋白的功能参与昼夜时钟的调控:磷酸化clock在'Thr-451'和'Thr-461',并调节clock - arntl /BMAL1异源二聚体的转录活性,改变稳定性和亚细胞分布。亚单位由CDK5和CDK5R组成的异源二聚体(p25)和至少由CDK5、CDK5R (p35)和CDK5RAP1或CDK5RAP2或CDK5RAP3组成的大分子复合物。只有异源二聚体显示激酶活性。与RASGRF2相互作用(通过相似性)。与EPHA4和NGEF相互作用;可能通过EPHA4介导NGEF的激活。复合物p35/CDK5与CLOCK相互作用。TISSUE SPECIFICITY Brain and neuron specific.PTM The p35 form is proteolytically cleaved by calpain, giving rise to the p25 form. P35 has a 5 to 10 fold shorter half-life compared to p25. The conversion results in deregulation of the CDK5 kinase: p25/CDK5 kinase displays an increased and altered tau phosphorylation in comparison to the p35/CDK5 kinase in vivo.PTM Myristoylated. A proper myristoylation signal is essential for the proper distribution of p35 (By similarity).PTM Ubiquitinated. Degradation of p35 by proteasome results in down-regulation of CDK5 activity. During this process, CDK5 phosphorylates p35 and induces its ubiquitination and subsequent degradation (By similarity).PTM Phosphorylation at Ser-8 and Thr-138 by CDK5 prevents calpain-mediated proteolysis.SIMILARITY Belongs to the cyclin-dependent kinase 5 activator family.
亩肌肉
NCBI分类学
10090
uniprot.
P61809.
2
平等的
n-myristoylglycine.
摩擦
mod:00068.
2
平等的
307
平等的
反应数据库ID版本77
8863426
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863426
反应
R-MMU-8863426
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MMU-8863426.1
反应
//www.joaskin.com
H2O.
水
反应DB_ID:29356
胞质
基因本体论
去:0005829
水(ChEBI: 15377)
水
Chebi.
Chebi:15377
反应数据库ID版本77
29356
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29356
反应
r-all-29356
5.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到反垃圾中此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-all-29356.5
化合物
C00001.
附加信息
心肌梗死
MI:0361
CDK5R1(2-98)
Reactome DB_ID: 8863422
2
平等的
98.
平等的
反应数据库ID版本77
8863422
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863422
反应
R-MMU-8863422
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MMU-8863422.1
P25.
CDK5R1(99-307)
反应DB_ID:8863427
99.
平等的
307
平等的
反应数据库ID版本77
8863427
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反应组:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863427
反应
R-MMU-8863427
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu-8863427.1
激活
从反垃圾中的EntitySet转换
Calpain1, Calpain2
反应DB_ID:8863425
Calpain1.
Reactome DB_ID: 8863432
CA2 +
钙
钙(2+)
反应DB_ID:140648
钙(2+)[Chebi:29108]
钙(2+)
Chebi.
CHEBI: 29108
反应数据库ID版本77
140648
数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=140648
反应
r-all-140648
4.
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-all-140648.4
化合物
C00076
4.
从反垃圾中的EntitySet转换
Capns.
Capns1, Capns2
反应DB_ID:8863452
Capns1.
Calpain小亚基1
cpns1_mouse.
Reactome DB_ID: 8863421
UNIPROT:O88456 CAPNS1
Capns1.
Capn4
钙调节的非溶酶体硫醇蛋白酶的功能调节亚基,其催化有限蛋白水溶性涉及细胞骨骼重塑和信号转导的底物蛋白分解。大(催化)和小(调节)亚基的ubinit同源体或异二聚体。在存在钙的存在下,异二聚体离解(通过相似性)。群群来自每种单体的第5次EF手域的接触允许形成同源过二聚体,并且还似乎介导大催化亚基和小型监管亚基之间的接触异二聚体的形成。域EF手域是配对的。EF-HAND 1与EF-HAND 2配对,EF手3与EF-HAND 4配对。第五次EF手域,留下未配对,不结合钙,但负责通过EF拥抱的二聚化。前四个EF手域结合钙,但是不确定EF-HAND 4与钙的结合是否在生理学上相关。
uniprot.
O88456.
1
平等的
269
平等的
反应数据库ID版本77
8863421
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863421
反应
R-MMU-8863421
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu -8863421.1
Capns2.
Calpain小亚基2
cpns2_mouse.
反应DB_ID:8863450
UNIPROT:Q9D7J7 CAPNS2
Capns2.
功能:钙调节的非溶酶体硫醇蛋白酶,催化有限的蛋白水解底物,参与细胞骨架重塑和信号转导。这种小亚基可以作为大亚基的组织特异性伴侣,可能通过帮助其折叠成其正确的活性(通过相似性)的正确构象。大(催化)和小(调节)亚基的ubonit杂二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二二聚体的。
uniprot.
Q9D7J7
1
平等的
247.
平等的
反应数据库ID版本77
8863450.
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id = 8863450
反应
r - mmu - 8863450
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu -8863450.1
反应数据库ID版本77
8863452
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863452
反应
R-MMU-8863452
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu -8863452.1
1
Capn1
Calpain-1催化亚基Ecnumber3.4.22.52 / Ecnumber
CAN1_MOUSE
Reactome DB_ID: 8863423
UNIPROT:O35350 CAPN1
Capn1
CANP1
CAPA1.
功能:钙调节的非溶酶体硫醇蛋白酶,催化有限的蛋白水解底物,参与细胞骨架重塑和信号转导。在Asn-375、Gly-388和His-410位点水解CTBP1。活性调节:微摩尔钙浓度激活,calpastatin抑制。亚基与一个小的(调节的)亚基CAPNS1形成异源二聚体。PTM经历钙诱导的连续的自身蛋白水解,产生膜结合的78 kDa活性形式和细胞内的75 kDa活性形式。Calpastatin高效地降低了78 kDa到75 kDa calpain形式的转变(通过相似性)。属于肽酶C2家族。
uniprot.
O35350.
2
平等的
713
平等的
反应数据库ID版本77
8863423
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863423
反应
R-MMU-8863423
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反应组:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu -8863423.1
1
反应数据库ID版本77
8863432.
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8863432
反应
R-MMU-8863432
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MMU-8863432.1
Calpain2.
Reactome DB_ID: 8863430
Capn2
Calpain-2催化亚基ecNumber3.4.22.53/ecNumber
can2_mouse.
Reactome DB_ID: 8863424
UniProt: O08529 Capn2
Capn2
功能:钙调节的非溶酶体硫醇蛋白酶,催化有限的蛋白水解底物,参与细胞骨架重塑和信号转导。在'Arg-226'位点水解MYOC(通过相似性)。神经元刺激后蛋白水解CPEB3,消除CPEB3翻译抑制因子活性,导致CPEB3靶mrna的翻译(PubMed:22711986)。活性调节:200-1000微摩尔钙激活,calpastatin抑制。亚基与一个小的(调控)亚基(CAPNS1)形成异源二聚体(通过相似性)。与CPEB3交互;这导致了CPEB3的裂解(PubMed:22711986)。组织特异性无处不在。属于肽酶C2家族。
uniprot.
o08529.
20.
平等的
700
平等的
反应数据库ID版本77
8863424
数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863424
反应
R-MMU-8863424
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu -8863424.1
1
7.
1
反应数据库ID版本77
8863430.
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8863430
反应
R-MMU-8863430
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mm -8863430.1
反应数据库ID版本77
8863425
数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863425
反应
R-MMU-8863425
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu -8863425.1
基因本体论
去:0004198
细胞功能的基因本体论术语
心肌梗死
MI:0355
相同的催化剂活性
反应数据库ID版本77
8863419
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863419
反应数据库ID版本77
8863416
数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=8863416
反应
R-MMU-8863416
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-mmu-8863416.1
10830966
PubMed.
2000年
神经毒性诱导CALPAIN的P35至P25的切割
李米年代
Kwon Y T
李,M.
彭,我
弗里德兰德,R M
Tsai,l h
自然405:360-4