在Reactome数据库中,BioPAX途径从“acsl1,3,5,6连接CoA到PALM形成PALM-CoA”。 从左到右 6.2.1.3 棕榈酸到棕榈酰辅酶a的转化 acsl1,3,5,6将CoA连接到PALM形成PALM-CoA 棕榈酸酯+ CoASH + ATP =>棕榈酰辅酶a + AMP +焦磷酸盐+ H2O 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 三磷酸腺苷 腺苷5 '三磷酸 ATP (4) Reactome DB_ID: 113592 胞质 基因本体论 去:0005829 ATP (4 -) (ChEBI: 30616) ATP (4) 三磷酸腺苷 三磷酸腺苷 腺苷5 '三磷酸 ChEBI CHEBI: 30616 Reactome数据库ID Release 77 113592 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113592 Reactome r - - 113592 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113592.5 Reactome //www.joaskin.com 复合 C00002 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 棕榈 棕榈酸 十六烷酸 棕榈酸酯 Reactome DB_ID: 3632881 棕榈酸(ChEBI: 15756) 十六烷酸 ChEBI CHEBI: 15756 Reactome数据库ID Release 77 3632881 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=3632881 Reactome r - - 3632881 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-3632881.3 复合 C00249 CoA-SH 辅酶A Reactome DB_ID: 76194 辅酶A (ChEBI: 15346) 辅酶A ChEBI CHEBI: 15346 Reactome数据库ID Release 77 76194 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=76194 Reactome r - - 76194 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-76194.3 复合 C00010 Reactome DB_ID: 29356 水(ChEBI: 15377) ChEBI CHEBI: 15377 Reactome数据库ID Release 77 29356 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29356 Reactome r - - 29356 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29356.5 复合 C00001 PPi 焦磷酸 diphosphoric酸 焦磷酸 二磷酸 Reactome DB_ID: 111294 diphosphoric酸(ChEBI: 29888) diphosphoric酸 ChEBI CHEBI: 29888 Reactome数据库ID Release 77 111294 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111294 Reactome r - - 111294 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-111294.3 复合 C00013 PALM-CoA palmitoyl-CoA Reactome DB_ID: 200993 palmitoyl-CoA (ChEBI: 15525) palmitoyl-CoA ChEBI CHEBI: 15525 Reactome数据库ID Release 77 200993 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=200993 Reactome r - - 200993 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-200993.3 复合 C00154 AMP 腺苷5’一磷酸 腺嘌呤核苷酸 腺苷酸 5 ' amp 5 '腺甙酸 5 '腺苷一磷酸 腺苷5 '磷酸 Reactome DB_ID: 76577 腺苷5’一磷酸(ChEBI: 16027) 腺苷5’一磷酸 ChEBI CHEBI: 16027 Reactome数据库ID Release 77 76577 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=76577 Reactome r - - 76577 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-76577.4 复合 C00020 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 同系物的ACSL3 Reactome DB_ID: 10711022 lcf1 ACSL3 O60135 Reactome DB_ID: 10711015 内质网的膜 基因本体论 去:0005789 UniProt: O60135 lcf1 粟酒裂殖酵母 NCBI分类法 4896 UniProt O60135 1 平等的 720 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10711015 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10711015 Reactome r -热点- 548787 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SPO-548787.1 lcf2 ACSL3 Q9P7D7 Reactome DB_ID: 10711020 UniProt: Q9P7D7 lcf2 UniProt Q9P7D7 1 平等的 720 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10711020 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10711020 Reactome r -热点- 548787 - 2 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SPO-548787-2.1 Reactome数据库ID Release 77 10711022 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10711022 Reactome r -热点- 548787 - 3 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SPO-548787-3.1 基因本体论 去:0004467 细胞功能的基因本体论术语 心肌梗死 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID Release 77 10711023 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10711023 Reactome数据库ID Release 77 10711025 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10711025 Reactome r -热点- 201035 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SPO-201035.1 膜相关酰基辅酶a合成酶长链家族成员1,3,5和6 (ACSL1,3,5,6)催化棕榈酸酯(PALM)与辅酶a结合形成棕榈酰辅酶a (PALM-CoA)。人类ACSL1尚未被详细描述,但现有数据表明,它专门与内质网膜有关,并可作用于油酸和棕榈酸(Malhotra et al. 1999, Fujimoto et al. 2007, Gassler et al. 2007)。 17379924 Pubmed 2007 ACSL参与人肝细胞HuH7胞质脂滴中中性脂质的局部合成 藤本,Y Itabe H 木下光男,T Homma KJ Onoduka J 森米 山口,年代 Makita, M 东,Y 山下先生, Takano T J血脂Res 48:1280-92 17681178 Pubmed 2007 酰基辅酶a合成酶5剪接对肠细胞凋亡的调控 Gassler N 罗斯,W 凡克,B 施耐德, 赫尔佐格,F Tischendorf, JJ 格伦德K Penzel R 布拉沃,搞笑 Mariadason J Ehemann V 图片我 哈斯,TL 查克,H Ganten T Zentgraf H Erb P 阿隆索, Autschbach F Schirmacher P Knuchel,露丝 Kopitz J 胃肠病学133:587 - 98 10548543 Pubmed 1999 人红细胞和红细胞前体中酰基辅酶a合成酶的鉴定和分子特征 Malhotra KT Malhotra K 卢宾,黑洞 kuyper,足总 物化学J 344:135-43 从电子注释推断 证据的代码 生态:0000203