在Reactome数据库中,BioPAX途径由“SORD氧化d -山梨醇到Fru”转化而来。 从左到右 1.1.1.14 SORD将D-山梨醇氧化为Fru 山梨糖醇+ NAD+ =>果糖+ NADH + H+ 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 山梨糖醇 D-葡萄糖醇 Reactome DB_ID: 5652213 胞质 基因本体论 去:0005829 D-葡萄糖醇[ChEBI:17924] D-葡萄糖醇 ChEBI CHEBI: 17924 Reactome数据库ID版本77 5652213 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5652213 Reactome r - - 5652213 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5652213.3 Reactome //www.joaskin.com 纳德 NAD + NAD (+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 DPN Diphosphopyridine核苷酸 Reactome DB_ID: 29360 NAD(1-[ChEBI:57540] NAD (1 -) 腺苷5'-{3-[1-(3-氨甲酰吡啶)-1,4-脱水-D-三硝基-5-基]二磷酸} NAD (+) NAD阴离子 ChEBI 车比:57540 Reactome数据库ID版本77 29360 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29360 Reactome r - - 29360 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29360.5 复合 C00003 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 Fru 果糖 果糖 果实糖 D-Arabino-hexulose Reactome DB_ID: 29532 果糖(ChEBI: 15824) 果糖 ChEBI CHEBI: 15824 Reactome数据库ID版本77 29532 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29532 Reactome R-ALL-29532 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29532.3 复合 C10906 复合 C00095 NADH Reactome DB_ID: 73473 NADH (2 -) (ChEBI: 57945) NADH (2 -) NADH二阶阴离子 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoyl-1 4-dihydropyridin-1-yl) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl]二磷酸} NADH ChEBI CHEBI: 57945 Reactome数据库ID版本77 73473 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=73473 Reactome r - - 73473 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-73473.4 复合 C00004 H+ 质子 海昌 Reactome DB_ID: 70106 海昌(ChEBI: 15378) 海昌 ChEBI CHEBI: 15378 Reactome数据库ID版本77 70106 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=70106 Reactome R-ALL-70106 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-70106.4 复合 C00080 激活 SORD四聚物 Reactome DB_ID: 10383642 SORD: Zn2 + Reactome DB_ID: 10383640 肮脏的 SORD A0A6I8PMG1 Reactome DB_ID: 10383638 UniProt:A0A6I8PMG1 肮脏的 非洲爪蟾蜍tropicalis NCBI分类法 8364 UniProt A0A6I8PMG1 2 相等的 357 相等的 Reactome数据库ID版本77 10383638 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10383638 Reactome r -额外的5652193 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-5652193.1 1 Zn2 + 锌+ + 锌(2+) 锌离子 锌(II) Reactome DB_ID: 29426 锌(2 +)(ChEBI: 29105) 锌(2+) ChEBI CHEBI: 29105 Reactome数据库ID版本77 29426 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29426 Reactome r - - 29426 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29426.3 复合 C00038 1 Reactome数据库ID版本77 10383640 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10383640 Reactome r -额外的5662476 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-5662476.1 4 Reactome数据库ID版本77 10383642 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10383642 Reactome r -额外的5652211 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-5652211.1 基因本体论 GO:0003939 细胞功能的基因本体论术语 心肌梗死 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID版本77 10383643 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10383643 Reactome数据库ID版本77 10383645 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10383645 Reactome r -额外的5652195 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-5652195.1 胞质SORD(山梨醇脱氢酶)催化D-山梨醇和NAD+反应生成果糖(Fru)和NADH+H+。Hers(1960)首次在绵羊精囊中描述了这种反应;O'Brien等人(1983年)鉴定了人类酶。活性酶是一种四聚体,含有四个相关的Zn2+离子(Pauly等人,2003年),其氨基末端蛋氨酸残基已被去除(Karlsson等人,1989年)。 14401391 Pubmed 1960 [精液果糖和胎儿果糖形成机制] 她的Henri-Gery 他。生物物理。Acta 37:127-38 6870831 Pubmed 1983 人类大脑的多元醇途径酶。山梨醇脱氢酶的部分纯化及性质研究 O ' brien,玛格丽特·M 斯科菲尔德,菲利普J 迈克尔·R·爱德华兹 生物化学。J.211:81-90 12962626 Pubmed 2003 人山梨醇脱氢酶的x射线晶体学和动力学研究 保利,托马斯 珍妮弗·L·埃克斯特罗姆 毕比,大卫 克伦尼克,鲍里斯 坎宁安,大卫 Griffor,马修 卡玛斯,阿吉思 李,爱德华。 马都拉,丽贝卡 Mcguire,德威特 认为,蒂莫西 Wasilko,大卫 瓦茨,保罗 Mylari Banavara L 欧茨,彼得·J 亚当斯,保罗D 弗吉尼亚州拉思 结构11:1071 - 85 2691249 Pubmed 1989 哺乳动物山梨醇脱氢酶的变异性。人肝酶的初级结构 卡尔森,克里斯蒂娜 Maret,沃尔夫冈 老的,道格拉斯年代 这位,Jan-Olov Jornvall,汉斯 欧元。J.生物化学。186:543-50 从电子注释推断 证据的代码 生态:0000203