BioPAX通路从“碳酸酐水合物二氧化碳(细胞溶质)”中的Reactome数据库转换。 从左到右 4.2.1.1 碳酸酐酶使二氧化碳水合物(胞质) 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 二氧化碳 二氧化碳 Reactome DB_ID:113528 cytosol. 基因本体论 去:0005829 二氧化碳[飞燕:16526] 二氧化碳 ChEBI CHEBI: 16526 Reactome数据库ID Release 77 113528 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113528 Reactome r - - 113528 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113528.3 Reactome //www.joaskin.com 复合 C00011 附加信息 心肌梗死 MI:0361 Reactome DB_ID: 29356 水(ChEBI: 15377) ChEBI CHEBI: 15377 Reactome数据库ID Release 77 29356 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29356 Reactome r - - 29356 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29356.5 复合 C00001 HCO3- 碳酸氢 hydrogencarbonate 酸碳酸 Reactome DB_ID: 111627 hydrogencarbonate (ChEBI: 17544) hydrogencarbonate ChEBI CHEBI: 17544 Reactome数据库ID Release 77 111627 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111627 Reactome r - - 111627 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-111627.3 复合 C00288 H + 质子 海昌 Reactome DB_ID: 70106 海昌(ChEBI: 15378) 海昌 ChEBI CHEBI: 15378 Reactome数据库ID Release 77 70106 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=70106 Reactome r - - 70106 4. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-70106.4 复合 C00080 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 CA1、2、3、7、13:锌 胞质碳酸酐酶 Reactome DB_ID: 10364474 CA1: Zn2 + Reactome DB_ID: 10364448 从Reactome中的EntitySet转换而来 同系物的CA1 Reactome DB_ID: 10364446 ca3 CA1 A0A6I8Q0N6 Reactome DB_ID: 10364440 UniProt: A0A6I8Q0N6 ca3 非洲爪蟾蜍tropicalis NCBI分类学 8364 uniprot. A0A6I8Q0N6 2 平等的 261. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364440 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364440 Reactome r -额外的1237027 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237027.1 CA1 car1_predicted Q0VFA2 Reactome DB_ID: 10364444 UniProt的:Q0VFA2 car1_predicted uniprot. Q0VFA2 2 平等的 261. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364444 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364444 Reactome R-XTR-1237027-2 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237027-2.1 Reactome数据库ID Release 77 10364446 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364446 Reactome R-XTR-1237027-3 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237027-3.1 1 Zn2 + 锌+ + 锌(2 +) 锌离子 锌(II) Reactome DB_ID: 29426 锌(2 +)(ChEBI: 29105) 锌(2 +) ChEBI CHEBI: 29105 Reactome数据库ID Release 77 29426 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29426 Reactome r - - 29426 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29426.3 复合 C00038 1 Reactome数据库ID Release 77 10364448 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364448 Reactome r -额外的1237322 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237322.1 游离钙:Zn2 + Reactome DB_ID: 10364456 从Reactome中的EntitySet转换而来 同系物的游离钙 Reactome DB_ID: 10364454 ca3 游离钙 A0A6I8Q0N6 Reactome DB_ID: 10364450 2 平等的 260. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364450 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364450 Reactome r -额外的1237012 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237012.1 游离钙 car1_predicted Q0VFA2 Reactome DB_ID: 10364452 2 平等的 260. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364452 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364452 Reactome r - xtr - 1237012 - 2所示 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237012-2.1 Reactome数据库ID Release 77 10364454 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364454 Reactome r - xtr - 1237012 - 3 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237012-3.1 1 1 Reactome数据库ID Release 77 10364456 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364456 Reactome r -额外的1237310 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237310.1 CA3:锌 Reactome DB_ID:10364462 1 ca3 CA3 F7CCF8 Reactome DB_ID:10364460 UniProt: F7CCF8 ca3 uniprot. F7CCF8 2 平等的 260. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364460 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364460 Reactome r -额外的1237014 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237014.1 1 Reactome数据库ID Release 77 10364462 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364462 Reactome r -额外的1237315 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237315.1 CA7:锌 Reactome DB_ID:10364468 ca7 CA7 Q28CD7 Reactome DB_ID:10364466 UniProt: Q28CD7 ca7 uniprot. Q28CD7 1 平等的 264. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364466 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364466 Reactome r -额外的1237021 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237021.1 1 1 Reactome数据库ID Release 77 10364468 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364468 Reactome r -额外的1237309 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237309.1 CA13:锌 Reactome DB_ID: 10364472 ca3 CA13 A0A6I8Q0N6 Reactome DB_ID: 10364470 1 平等的 262. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10364470 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364470 Reactome r -额外的1237020 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237020.1 1 1 Reactome数据库ID Release 77 10364472 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364472 Reactome r -额外的1237321 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1237321.1 Reactome数据库ID Release 77 10364474 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364474 Reactome r -额外的1475034 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1475034.1 基因本体论 GO:0004089 细胞功能的基因本体论术语 心肌梗死 MI:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID Release 77 10364475 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364475 Reactome数据库ID Release 77 10364481 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10364481 Reactome r -额外的1475026 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1475026.1 碳酸酐酶I(CA1,哈里发1971年,Simonsson等人。1982年,仁和1992年Lindskog),碳酸anyhydrase II(CA2,Tibell等人。1984年,琼斯和肖1983年,Pesando 1975年,Ghannam等,1986),碳酸酐酶III(CA3,Carter等人,1979,涂等人,1990,涂等人,1994,涂1998等,Silverman等人,1993),碳酸酐酶VII(CA7,Bootorabi等人,2010,Gitto等人。2010)水合物二氧化碳产量碳酸氢盐和质子。碳酸酐酶的水去质子化,得到锌 - 羟基和其在碳酸酐酶通过组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲器分子的质子。在活性位点与二氧化碳的羟基反应生成碳酸氢盐。一个水分子置换碳酸氢盐和反应周期开始(在1997年Lindskog综述)一次。取决于反应物的浓度的反应是可逆的。结果,CA2和CA7具有高的催化活性,CA1具有低活性(CA2的活性的10%),和CA3具有非常低的活性(CA2的活性的1%)。CA1和CA2红细胞被发现。CA2也在肾,肺,和白肌其中它有利于二氧化碳的扩散找到。CA3是在它的抗氧化应激性参与红色肌肉中发现。 20578724 Pubmed 2010 人碳酸酐酶质子转移扩展位点的结构和动力学研究II Domsic,摩根富林明 威廉姆斯,W 费舍尔,深圳 你,C Agbandje-McKenna, M 西尔弗曼,DN 麦肯纳,R 生物化学49:6394-9 6407977 Pubmed 1983 常见的人红细胞碳酸酐酶II及其次要成分和一个新的遗传变体CA II墨尔本(237 Pro leads to His)的化学和酶学比较 琼斯,GL 肖特区 哼麝猫63:392-9 120192 Pubmed 1979 来自骨骼肌的人碳酸酐酶III的特征 卡特,N 杰弗瑞,年代 Shiels,A 爱德华兹,Y Tipler,T 霍普金森,哒 生化遗传学17:837-54 1554744 Pubmed 1992 人碳酸酐酶催化CO2水合作用的缓冲依赖性I 任,X Lindskog,S 生物化学生物物理学报1120:81-6 8399223 Pubmed 1993 人碳酸酐酶分子内质子转移的速率平衡关系III 西尔弗曼,DN 你,C 陈,X 唐怀瑟,SM 责任,AJ Laipis,PJ 生物化学32:10757-62 8083199 Pubmed 1994 活性位点残基和人碳的催化活性的相互作用酸酐酶III 你,C 陈,X 任,X LoGrasso,光伏 朱厄尔,DA Laipis,PJ 西尔弗曼,DN J Biol Chem 269:23002-6 20493921 Pubmed 2010 体外表达的人碳酸酐酶VII的缩短形式的分析相比全长酶 Bootorabi,F 詹尼斯·J 史密斯,E 瓦希德,A Kukkurainen,年代 Hytonen V Valjakka,J Supuran,CT Vullo D 狡猾的,威廉年代 Parkkila,年代 Biochimie 92:1072至1080年 3080418 Pubmed 1986 碳酸酐酶ii催化CO2水合反应的活化参数 Ghannam,AF Tsen W 罗利特,RS J Biol Chem 261:1164-9 9635771 Pubmed 1998 碳酸酐酶分子内质子转移的性质III 你,C 钱,米 Earnhardt,约 Laipis,PJ 西尔弗曼,DN Biophys J 74:3182-9 9336012 Pubmed 1997 结构与碳酸酐酶的机制 Lindskog,S 杂志74:1-20 4994926 Pubmed 1971 碳酸酐酶的二氧化碳水合活性。人类原生同工酶B和C的止流动力学研究 哈里发,RG J Biol Chem 246:2561-73 2169869 Pubmed 1990 人类碳酸酐酶III催化质子转移的缓冲增强 你,CK Paranawithana,SR 朱厄尔,DA 唐怀瑟,SM LoGrasso,光伏 永利,GC Laipis,PJ 西尔弗曼,DN 生物化学29:6400-5 6433979 Pubmed 1984 人碳酸酐酶催化CO2水合反应的阴离子抑制II。机械的影响 Tibell L Forsman声称通过C Simonsson,我 Lindskog,S 生物化学生物物理学报789:302-10 234739 Pubmed 1975 碳酸酐酶的质子磁共振研究。II。集团控制的催化活性 Pesando, JM 生物化学14:681-8 17427958 Pubmed 2007 人碳酸酐酶III活性位点质子穿梭残基的结构和动力学分析 长老,我 费舍尔,Z Laipis,PJ 你,C 麦肯纳,R 西尔弗曼,DN 蛋白质68:337-43 21282642 Pubmed 2011 分子内质子穿梭不仅支持碳酸酐酶的催化功能,也支持碳酸酐酶的非催化功能 贝克尔,嗯 Klier,男 舒勒,C 麦肯纳,R Deitmer, JW 国家科学院院刊U S A 108:3071-6 6819139 Pubmed 1982 CO2 / HCO-3交换人类碳酸酐酶催化的我一13C核磁共振研究 Simonsson,我 乔森,BH Lindskog,S Eur J Biochem 129:165-9 20349499 Pubmed 2010 高效和选择性的人碳酸酐酶VII (hCA VII)抑制剂的鉴定 Gitto R Agnello,年代 铁,年代 Vullo D Supuran,CT Chimirri, ChemMedChem 5:823-6 22001224 Pubmed 2011 结构和催化的碳酸酐酶II:活性位点的作用色氨酸5 Mikulski R Domsic,摩根富林明 凌,G 你,C 罗宾斯,啊 西尔弗曼,DN 麦肯纳,R Arch Biochem biophysics 516:97-102 从电子注释推断 证据的代码 ECO:0000203