bioax途径由Reactome数据库中“tnfr1介导的神经酰胺生产”转化而来。 TNFR1-mediated神经酰胺生产 这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

这一推断是基于黑豹的同源性映射。简言之,所有涉及的物理量(输入、输出和催化剂)都有一个映射的正态/旁态(对于络合物,至少75%的组分必须有一个映射)的反应被推断为其他物种。还为这些事件推断出高级事件,以便于导航。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp 从左到右 tnf: TNFR1 NSMAF结合 这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

这一推断是基于黑豹的同源性映射。简言之,所有涉及的物理量(输入、输出和催化剂)都有一个映射的正态/旁态(对于络合物,至少75%的组分必须有一个映射)的反应被推断为其他物种。还为这些事件推断出高级事件,以便于导航。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp 从Reactome中的EntitySet转换而来 tnf三聚物:TNF-R1三聚物 反应DB_ID:10212518 TNF-α:TNFR1 反应DB_ID:10212506 血浆膜 基因本体 GO:0005886 TNF(1-233)三聚体 反应DB_ID:10212504 从Reactome中的EntitySet转换而来 同系物的肿瘤坏死因子(1 - 233) 反应DB_ID:10212502 肿瘤坏死因子 TNF(1-233) Q1L8A5 反应DB_ID:10212496 UNIPROT:Q1L8A5 肿瘤坏死因子 Danio Rerio. 分类学 7955 UniProt Q1L8A5 1. 平等的 233 平等的 反应数据库ID版本77 10212496. 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反应组:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10212496 反应 r - dre - 66220 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-66220.1 反应 //www.joaskin.com tnfb TNF(1-233) Q4W898. 反应DB_ID:10212500 UNIPROT:Q4W898 tnfb UniProt Q4W898. 1. 平等的 233 平等的 反应数据库ID版本77 10212500 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212500 反应 R-DRE-66220-2 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-66220-2.1 反应数据库ID版本77 10212502 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212502 反应 R-DRE-66220-3 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-66220-3.1 3. 反应数据库ID版本77 10212504 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212504 反应 R-DRE-3371351 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-3371351.1 1. F1QQS0 tnfrsf1a TNFRSF1A(22-455) 反应DB_ID:10212492 UniProt: F1QQS0 tnfrsf1a UniProt F1QQS0 22 平等的 455 平等的 反应数据库ID版本77 10212492. 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10212492 反应 r - dre - 66344 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-66344.1 3. 反应数据库ID版本77 10212506 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212506 反应 r - dre - 74277 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-74277.1 可溶性tnf: TNFR1 反应DB_ID:10212516 TNF-alpha三聚体,可溶性形式 反应DB_ID:10212514 胞外区 基因本体 去:0005576 从Reactome中的EntitySet转换而来 同系物的TNF (77 - 233) 反应DB_ID:10212512 肿瘤坏死因子 肿瘤坏死因子(77-233) Q1L8A5 反应DB_ID:10212508 77. 平等的 233 平等的 反应数据库ID版本77 10212508 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212508 反应 R-DRE-976821 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-976821.1 tnfb 肿瘤坏死因子(77-233) Q4W898. 反应DB_ID:10212510 77. 平等的 233 平等的 反应数据库ID版本77 10212510 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212510 反应 r - dre - 976821 - 2 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-976821-2.1 反应数据库ID版本77 10212512 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212512 反应 r - dre - 976821 - 3 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-976821-3.1 3. 反应数据库ID版本77 10212514 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212514 反应 R-DRE-3371370 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-3371370.1 1. 3. 反应数据库ID版本77 10212516 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212516 反应 R-DRE-3371397 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-3371397.1 反应数据库ID版本77 10212518 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212518 反应 r -衣服3371401 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-3371401.1 nsmaf NSMAF F1QZ06 反应数据库ID:10285312 胞浆 基因本体 去:0005829 UNIPROT:F1QZ06. nsmaf UniProt F1QZ06 1. 平等的 917 平等的 反应数据库ID版本77 10285312. 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10285312 反应 R-DRE-5626992 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626992.1 tnf: TNFR1: NSMAF 反应DB_ID:10285314 1. 1. 反应数据库ID版本77 10285314 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10285314 反应 r -衣服5626996 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626996.1 反应数据库ID版本77 10285324 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10285324 反应 R-DRE-5626988 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-5626988.1 TNFR1诱导的TNF-α信号传导促进鞘磷脂磷酸二酯酶(鞘磷脂酶或SMASE)信号通路的激活。SMASE是一个激动剂激活效应酶家族,可水解膜室上的磷脂以产生神经酰胺,一种脂质信号分子。

与中性鞘磷脂酶激活(FAN或NSMAF)相关的因子是一种组成性结合TNFR1中性SMASE激活域(NSD)的衔接蛋白(Adam Klages S et al.1996)。NSMAF(FAN)被认为直接将TNFR1与中性鞘磷脂磷酸二酯酶(SMPD2,SMPD3)等中性鞘磷脂磷酸二酯酶(N-SMASE)的激活联系起来。 11435466 PubMed. 2001年 FAN参与tnf诱导的细胞凋亡 Segui B Cuvillier,O. Adam-Klages, Sabine 加西亚,V 马拉加里卡泽纳夫,S 桑德琳,年代 Caspar-Bauguil,年代 这,我 Salvayre R 克伦克,M levade,T. J. Clin。投资。108:143-51 8808629 PubMed. 1996 FAN是一种新的WD重复蛋白,将p55 TNF受体与中性鞘磷脂酶偶联 Adam-Klages, Sabine 亚当,饮食 Wiegmann,K 特斯。特鲁夫,年代 科拉诺斯,W Schneider-Mergener J 克伦克,M 电池86:937-47 8663014 PubMed. 1996 p55肿瘤坏死因子受体的一个新胞质结构域启动中性鞘磷脂酶途径 亚当,饮食 Wiegmann,K Adam-Klages, Sabine 拉夫, 克伦克,M 生物。化学271:14617-22 从电子注释推断 证据代码 ECO:0000203 从左到右 tnf: TNFR1: NSMAF GNB2L1结合 这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

这一推断是基于黑豹的同源性映射。简言之,所有涉及的物理量(输入、输出和催化剂)都有一个映射的正态/旁态(对于络合物,至少75%的组分必须有一个映射)的反应被推断为其他物种。还为这些事件推断出高级事件,以便于导航。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp gnb2l1 GNB2L1 O42248 反应DB_ID:10282391 UniProt:O42248 gnb2l1 UniProt O42248 2. 平等的 317 平等的 反应数据库ID版本77 10282391. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10282391 反应 R-DRE-5626956 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626956.1 tnf: TNFR1: NSMAF: GNB2L1 反应DB_ID:10285316 1. 1. 反应数据库ID版本77 10285316. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10285316 反应 r -衣服5626997 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626997.1 反应数据库ID版本77 10285322 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10285322 反应 R-DRE-5626982 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626982.1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白亚基-2-like 1 (GNB2L1),也被称为活化蛋白激酶C (RACK1)的受体,通过谷胱甘肽s -转移酶为基础的共沉淀实验以及使用人胚胎肾293 (HEK293)细胞的共免疫沉淀实验表明,在体外与NSMAF (FAN)相互作用(Tcherkasowa AE et al. 2002)。共聚焦激光扫描显微镜研究表明,过表达的NSMAF (FAN)和GNB2L1 (RACK)与TNFR1共同定位于质膜(Tcherkasowa AE et al. 2002)。此外,借助生物素化的TNF和MACS Streptavidin微珠从TNF刺激的Jurkat或HeLa细胞中分离出含有囊泡的TNF受体,并结合免疫印迹试验显示GNB2L1(RACK1)与TNFR1相互作用(Philipp S et al. 2010)。数据提示GNB2L1(RACK1)调节TNF触发的中性鞘磷脂酶(N-SMASE)的激活。 12391233 PubMed. 2002年 与中性鞘氨醇髓鞘酶激活相关因子(一种含有WD基序的蛋白质)的相互作用,确定激活的C-激酶1受体是p55 TNF受体信号通路的一个新组成部分 切卡索娃,安娜·伊根杰娜 Adam-Klages, Sabine 克鲁斯,Marie-Luise Wiegmann,卡佳 马修,Sabine Kolanus,Waldemar. Krönke,马丁 亚当,饮食 j . Immunol 169:5161 - 70 20080539. PubMed. 2010年 Polycomb组蛋白EED将TNF受体1与中性鞘磷脂酶结合 Philipp,Stephan. Puchert,马尔特• Adam-Klages, Sabine Tchikov弗拉基米尔• Winoto-Morbach,Supandi 马修,Sabine Deerberg,安德里亚 科尔克,Ljudmila Marchesini,Norma. 迪特·卡贝利茨 汉恩,yusuf a 舒茨,斯特凡 亚当,饮食 Proc。国家的。学会科学。美国107:1112-7 从左到右 TNF-α:TNFR1:NSMAF:GNB2L1与SMPD2,3相关 这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

这一推断是基于黑豹的同源性映射。简言之,所有涉及的物理量(输入、输出和催化剂)都有一个映射的正态/旁态(对于络合物,至少75%的组分必须有一个映射)的反应被推断为其他物种。还为这些事件推断出高级事件,以便于导航。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp 从Reactome中的EntitySet转换而来 SMPD2,3 Reactome DB_ID: 10260102 SMPD2. SMPD2B. E7FBR1 Reactome DB_ID: 10260096 UniProt:E7FBR1 SMPD2B. UniProt E7FBR1 1. 平等的 423 平等的 反应数据库ID版本77 10260096 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10260096 反应 r - dre - 194337 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-194337.1 SMPD3. SMPD3. B1B5D9 Reactome DB_ID: 10260100 UniProt: B1B5D9 SMPD3. UniProt B1B5D9 1. 平等的 655 平等的 反应数据库ID版本77 10260100 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10260100 反应 R-DRE-1606265 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-1606265.1 反应数据库ID版本77 10260102 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10260102 反应 R-DRE-1606272 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-1606272.1 TNF-alpha:TNFR1:NSMAF:GNB2L1:SMPD2,3 反应DB_ID:10285318 1. 1. 反应数据库ID版本77 10285318. 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10285318 反应 R-DRE-5626990 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-5626990.1 反应数据库ID版本77 10285320 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10285320 反应 R-DRE-5626981 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626981.1 鞘脂信号由中性鞘磷脂酶(中性SMASE)启动,后者是激动剂激活的效应酶家族。 反应数据库ID版本77 10323786. 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10323786 反应 R-DRE-5626978 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-5626978.1 基因本体 去:2000304 细胞过程的基因本体论术语 心肌梗死 MI:0359 TNF-α激活鞘磷脂酶(SMASE)蛋白以催化鞘鞘素的水解进入神经酰胺。可以在TNFR1信号传导,酸和中性侧面的下游区分两种类型的SMase(Adam-Klages S等人。1996,1998)。中性Smase(例如SMPD2,3)的pH值为7.4,需要Mg2 +离子,并在血浆膜(Rao Bg和Spence Mw 1976)中发现。酸液在pH 4-5下活性,是Zn2 +依赖性,主要是溶酶体中的局部化。负责凋亡途径引发的TNFR1的死亡结构域也介导酸液的激活。两种促凋亡适配器蛋白质Tradd和Fadd也参与了酸剧信号传导事件的激活(Schwandner R等人。1998)。TNF-α还可以通过Caspase-8介导的Caspase-7激活促凋亡酸性Smase,其源于蛋白水解地切割并激活72KDA pro-acid Smase形式(Edelmann B等人。2011)。中性SMASE(SMPD)与适配器蛋白NSMAF(风扇)结合,它将其桥接到TNFR1的NSMase-Activating域(NSD)(Adam D等人1996; Adam-Klages S等人。1996;Séguib等人。2001)。SMPD2,3的激活导致Celamide在细胞表面的积累。锡酰胺代谢产生的生物活性脂质的级联,所有这些都携带特定的信号传导能力。可以通过CeraMid酶转化为鞘氨酰醇的神经酰胺,其又通过鞘氨醇激酶磷酸化成鞘氨酸-1-磷酸(S1P)。 These lipids exert opposite biological effects: ceramide and sphingosine are able to induce anti-proliferative and pro-apoptotic responses, whereas S1P is a cytoprotective molecule that promotes cell growth and counteracts apoptotic stimuli (Cuvillier O et al.1996) 8657285. PubMed. 1996 鞘氨醇-1-磷酸抑制神经酰胺介导的程序性细胞死亡 Cuvillier,O. Pirianov G Kleuser B 瓦内克,P G Coso,O A 勇气 明镜,年代 自然381:800-3 9488730. PubMed. 1998 TNF受体死亡域相关蛋白质TRADD和酸鞘氨基氨基酶的FADD信号激活 施瓦德纳,R. Wiegmann,K 伯纳多,K Kreder D 克罗克,M 生物。化学。273:5916-22 9620659 PubMed. 1998 不同的衔接子蛋白介导酸与中性鞘蛋白酶激活通过P55受体进行肿瘤坏死因子 Adam-Klages, Sabine 施瓦德纳,R. 亚当,饮食 Kreder D 伯纳多,K 克伦克,M j . Leukoc。生物63:678 - 82 9463 PubMed. 1976年 在人脑中pH7.4的鞘磷脂酶活性,与pH 5.0的活性进行比较 Rao,B G 斯彭斯,M W J. Lipid Res。17:506-15