BioPAX途径由Reactome数据库中的“NLRP1炎症小体”转化而来。 该NLRP1炎性 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 从左到右 Bcl-2和Bcl-XL结合NLRP1 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp NLRP1 NLRP1 F6Y5Q8 Reactome DB_ID: 9987898 胞质 基因本体论 去:0005829. UniProt: F6Y5Q8 NLRP1 犬属后裔 NCBI分类法 9615 UniProt F6Y5Q8 1 平等的 1473 平等的 反应数据库ID版本77 9987898 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987898 反应 r - cfa - 561196 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-561196.1 反应 //www.joaskin.com 从Reactome中的EntitySet转换而来 bcl - 2 / Bcl-X(左) Reactome DB_ID: 9988073 BCL2 BCL2 E2QWA1 Reactome DB_ID:9962569 线粒体外膜 基因本体论 去:0005741 UniProt: E2QWA1 BCL2 UniProt E2QWA1 1 平等的 239 平等的 反应数据库ID版本77 9962569 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9962569 反应 r - cfa - 50757 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-50757.1 BCL2L1 BCL2L1 Q76LT7 Reactome DB_ID:9987185 UniProt: Q76LT7 BCL2L1 UniProt Q76LT7 1 平等的 233 平等的 反应数据库ID版本77 9987185 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987185 反应 r - cfa - 114236 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-114236.1 反应数据库ID版本77 9988073 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9988073 反应 r - cfa - 879209 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-879209.1 BCL-2 / BCL-X(L):NLRP1 Reactome DB_ID: 9988075 1 1 反应数据库ID版本77 9988075 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9988075 反应 r - cfa - 879218 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-879218.1 反应数据库ID版本77 9988077 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9988077 反应 R-CFA-879201 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-879201.1 抗凋亡蛋白Bcl-2和Bcl-XL(而不是Mcl-1、Bcl-W、Bfl-1或Bcl-B)与NLRP1结合,阻止了mdmp诱导的激活。 17418785 PubMed. 2007年 Bcl-2和Bcl-xL的通过与NALP1相互作用调节促炎胱天蛋白酶-1激活 Bruey,JM Bruey-Sedano,N 卢西亚诺,F 翟,D Balpai R 徐,C 克雷斯,CL 贝利-领班,B 李,X 奥斯特曼,A Matsuzawa,年代 Terskikh, AV Faustin B 芦苇,JC 细胞129:45-56 从电子注释推断 证据法典 生态:0000203 从左到右 NLRP1感官MDP 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp MDP. 胞壁二肽 Reactome DB_ID: 708341 胞壁二肽(ChEBI: 59414) 胞壁二肽 ChEBI CHEBI: 59414 反应数据库ID版本77 708341 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=708341 反应 R-ALL-708341 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-708341.4 MDP:NLRP1 Reactome DB_ID:9987900 1 1 反应数据库ID版本77 9987900 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987900 反应 R-CFA-877370 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-877370.1 反应数据库ID版本77 9987908 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987908 反应 r - cfa - 844447 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-844447.1 使用纯化NLRP1和caspase-1的体外研究表明,MDP诱导NLRP1的构象变化,使其与核苷酸结合并寡聚,为caspase-1创建一个结合平台(Faustin et al. 2008)。目前尚无直接证据表明NLRP1与MDP结合,因此刺激NLRP1的机制尚不清楚。 17349957 PubMed. 2007年 重构NALP1炎性揭示了胱天蛋白酶-1激活的两步机制 Faustin B 拉提,我 Bruey,JM 卢西亚诺,F Sergienko E 贝利-领班,B 福,N Hanein,d Rouiller,我 芦苇,JC 摩尔细胞25:713-24 从左到右 MDP:NLRP1 ATP绑定 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp atp. 三磷酸腺苷 ATP(4-) Reactome DB_ID: 113592 ATP (4 -) (ChEBI: 30616) ATP(4-) atp. ATP 三磷酸腺苷 ChEBI CHEBI: 30616 反应数据库ID版本77 113592 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113592 反应 R-ALL-113592 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113592.5 复合 C00002 额外的信息 MI. 小姐:0361 MDP: NLRP1: ATP Reactome DB_ID:9987902 1 1 反应数据库ID版本77 9987902 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987902 反应 r - cfa - 879207 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-879207.1 反应数据库ID版本77 9988089 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9988089 反应 r - cfa - 879222 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-879222.1 MDP可诱导NLRP1的构象变化使ATP结合,需要NLRP1低聚(福斯坦等2007人)中。 从左到右 NLRP1 oligomerizes 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp MDP:NLRP1:ATP低聚物 Reactome DB_ID:9987904 反应数据库ID版本77 9987904 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987904 反应 R-CFA-1296412 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-1296412.1 反应数据库ID版本77 9987906 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9987906 反应 R-CFA-844438 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-844438.1 在镁离子的存在下NLRP1观察到具有改变的电泳迁移率的溶液中加入MDP时。这被解释为NLRP1齐聚的证据。低聚的程度是未知的。 反应数据库ID版本77 10045787 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10045787 反应 R-CFA-844455 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-844455.1 NLRP1由MDP激活(福斯坦等人,2007)。所述NLRP1炎性是第一个来表征。它被描述为一种复杂的含有NALP1,ASC,胱天蛋白酶-1和胱天蛋白酶5(Martinon等人,2002)。不像NLRP3,NLRP1具有包含CARD结构域,其已报道直接与胱天蛋白酶原-1相互作用(福斯坦等人,2007)的C-末端延伸,避免了ASC的要求,虽然ASC被发现增强的相互作用。鼠标NLRP1没有PYD域,因此不期望直接与胱天1进行交互。像NLRP3炎性,K +流出似乎是胱天蛋白酶-1激活是必需的(威克利夫等人,2008)。核糖核苷三磷酸(的NTPs)所需要的NALP1介导的胱天蛋白酶-1激活与ATP是最有效的,Mg2 +的还需要(福斯坦等人,2007)。人类NLRP1基因在小鼠3个旁系同源物是高度多态的。小鼠品系背后的易感性之间的差异,以炭疽致死毒素(博伊登&2006迪特里希)。 17850338 PubMed. 2008年 炭疽致死毒素诱导的炎性小体形成和caspase-1激活是依赖于离子通量和蛋白酶体的晚期事件 Wickliffe,客 Leppla,斯蒂芬·H Moayeri,Mahtab 细胞微生物学10:332-43 12191486 PubMed. 2002年 炎症小体:触发炎性半胱天冬酶激活和前il - β加工的分子平台 Martinon,F 伯恩斯,K Tschopp, Jurg 摩尔细胞10:417-26 16429160 PubMed. 2006年 Nalp1b控制小鼠巨噬细胞对炭疽致命毒素的敏感性 Boyden ED 迪特里希,WF 纳特遗传学38:240-4