在Reactome数据库中,BioPAX途径由“best transport cytosolic HCO3- to cell outside region”转变。 从左到右 BESTs运输胞质HCO3-到细胞外区域 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp HCO3 - 碳酸氢 hydrogencarbonate 碳酸盐岩酸 Reactome DB_ID: 111627 胞质 基因本体论 去:0005829 hydrogencarbonate (ChEBI: 17544) hydrogencarbonate ChEBI CHEBI: 17544 Reactome数据库ID Release 77 111627 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111627 Reactome r - - 111627 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-111627.3 Reactome //www.joaskin.com 复合 C00288 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 HCO3 - 碳酸氢 hydrogencarbonate 碳酸盐岩酸 Reactome DB_ID: 425425 细胞外区域 基因本体论 去:0005576 Reactome数据库ID Release 77 425425 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=425425 Reactome r - - 425425 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-425425.3 复合 C00288 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 最好成绩 Bestrophins Reactome DB_ID: 10006215 BEST1 BEST1 A0A5F4DJ28 Reactome DB_ID: 10006201 等离子体膜 基因本体论 去:0005886 UniProt: A0A5F4DJ28 BEST1 犬属后裔 NCBI分类法 9615 UniProt A0A5F4DJ28 1 平等的 585 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10006201 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006201 Reactome r - cfa - 2744365 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-2744365.1 BEST2 BEST2 E2RSZ4 Reactome DB_ID: 10006205 UniProt: E2RSZ4 BEST2 UniProt E2RSZ4 1 平等的 509 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10006205 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006205 Reactome r - cfa - 2744359 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-2744359.1 BEST3 BEST3 F6UZK5 Reactome DB_ID: 10006209 UniProt: F6UZK5 BEST3 UniProt F6UZK5 1 平等的 668 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10006209 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006209 Reactome r - cfa - 2744362 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-2744362.1 BEST4 BEST4 E2RGI8 Reactome DB_ID: 10006213 UniProt: E2RGI8 BEST4 UniProt E2RGI8 1 平等的 473 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10006213 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006213 Reactome r - cfa - 2744358 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-2744358.1 Reactome数据库ID Release 77 10006215 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006215 Reactome r - cfa - 2744364 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-2744364.1 基因本体论 去:0015106 细胞功能的基因本体论术语 心肌梗死 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID Release 77 10006219 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006219 Reactome数据库ID Release 77 10006221 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10006221 Reactome r - cfa - 2752067 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-2752067.1 许多Cl-通道,如CFTR、ClC、CaCC,以及配体门控阴离子通道,都可被碳酸氢盐(HCO3-)渗透,而HCO3-是调节ph的重要阴离子。包括视网膜色素上皮(RPE)在内的许多组织,都利用HCO3-转运体介导HCO3-的转运。Bestrophns 1-4 (BEST1-4,又名卵黄状黄斑营养不良蛋白)对HCO3-具有高渗透性(Hu & Hartzell 2008)。BEST1缺陷可能在HCO3-和Cl-电导受损导致的眼睛黄斑变性中发挥作用(Hu & Hartzell, 2008)。 18400985 Pubmed 2008 Bestrophin Cl-通道对HCO3-具有很高的渗透性 曲,志强 Hartzell H·克里斯 点。j .杂志。, Cell Physiol. 294:C1371-7 从电子注释推断 证据的代码 生态:0000203