在Reactome数据库中,BioPAX途径由“CstF募集到CPSF结合的Pre-mRNA”转变。 CstF的募集到CPSF结合的Pre-mRNA CstF的募集到CPSF结合的Pre-mRNA 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 9957471 1 核浆 0005654. CstF(核浆) CstF 反应DB_ID:9957455 1 UniProt: E2QUB3 CSTF1 Reactome //www.joaskin.com 犬属后裔 NCBI分类法 9615 UniProt E2QUB3 链坐标 1 平等的 431 平等的 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 9957469 1 CSTF2, CSTF2T(核浆) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity CSTF2(核浆) CSTF2T [Nocleoplasm] UniProt E2RP40 UniProt J9P8Y3 反应DB_ID:9957459 1 UniProt: E2R479 CSTF3 UniProt E2R479 1 平等的 717 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9957471 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9957471 Reactome r - cfa - 72006 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-72006.1 Reactome DB_ID: 9960686 1 CPSF:帽状无内含子pre-mRNA:CBC复合物[核质] CPSF:capped intronless pre-mRNA:CBC复合物 Reactome DB_ID: 9960684 1 盖住Intronless前预mRNA:CBC复合物[核质] 无内含子的pre-mRNA:CBC复合物 Reactome DB_ID: 9956718 1 UNIPROT:A0A5F4CB90. UniProt A0A5F4CB90 1 平等的 156 平等的 Reactome DB_ID: 9956722 1 UniProt: F1PUP7 NCBP1 UniProt F1PUP7 1 平等的 790 平等的 Reactome DB_ID: 112158 1 帽状无内含子pre-mRNA[核质] 封顶intronless pre-mRNA Reactome数据库ID Release 77 9960684 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id = 9960684 Reactome r - cfa - 112159 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-112159.1 反应DB_ID:9957451 1 CPSF [核质] CPSF Reactome DB_ID: 9957445 1 UniProt: F1PSM3 SYMPK UniProt F1PSM3 1 平等的 1274 平等的 Reactome DB_ID: 9957429 1 UniProt: E2R496 CPSF2 UniProt E2R496 1 平等的 782 平等的 Reactome DB_ID: 9957449 1 UNIPROT:F1PV59. WDR33 UniProt F1PV59 2 平等的 1336 平等的 Reactome DB_ID: 9957433 1 UNIPROT:E2R7R2. CPSF3 UniProt E2R7R2 1 平等的 684 平等的 Reactome DB_ID: 9957441 1 UniProt: J9P398 CPSF4 UniProt J9P398 1 平等的 269 平等的 Reactome DB_ID: 9957425 1 UniProt: J9P418 CPSF1 UniProt J9P418 1 平等的 1443. 平等的 Reactome DB_ID: 9957437 1 UniProt: E2RJT7 FIP1L1 UniProt E2RJT7 1 平等的 594 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9957451 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9957451 Reactome R-CFA-71995 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-71995.1 Reactome数据库ID Release 77 9960686 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9960686 Reactome r - cfa - 112160 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-112160.1 反应DB_ID:9960690 1 CstF:CPSF:capped intronless pre-mRNA:CBC complex[核质] CstF:CPSF:capped intronless pre-mRNA:CBC复合物 Reactome DB_ID: 9957471 1 Reactome DB_ID: 9960686 1 Reactome数据库ID Release 77 9960690 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9960690 Reactome r - cfa - 112161 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-112161.1 Reactome数据库ID Release 77 9960692 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9960692 Reactome r - cfa - 77590 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CFA-77590.1 内切分裂将pre-mRNA分离成一个上游片段注定成为成熟的mRNA和一个下游片段迅速降解。多聚腺苷酸化和切割同时发生,复合物共组装,切割依赖于RNA中的两个信号,一个高度保守的六核苷酸,AAUAAA,切割位点上游10到30个核苷酸,和一个不太保守的GU-或U-rich下游元件。额外的序列,通常是在AAUAAA的上游,可以提高反应的效率。卵裂最常发生在CA二核苷酸之后。一个基因可以有一个以上的3'加工位点。

裂解前装配一个大的加工复合体,该复合体的成分很不明确。装配需要ATP,而不是它的水解。裂解取决于许多蛋白质因子。CPSF是一种异四聚体,特异地与AAUAAA序列结合。异源三聚体CstF与富含GU或u的下游元件结合。 10371034 PubMed. 1999 3'-终端处理真核生物前mRNA。 Wahle,埃尔 Ruegsegger U FEMS Microbiol Rev 23:277-95 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构