bioax途径由Reactome数据库中“NCOA3结合ESR1:estrogen:TFGA基因”转化而来。 NCOA3结合ESR1:雌激素:TFGA基因 NCOA3结合ESR1:雌激素:TFGA基因 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 9945452 1 核浆 0005654 ESR1二聚体:雌激素:TGFA基因启动子[核质] ESR1二聚体:雌激素:TGFA基因启动子 Reactome DB_ID: 9945448 1 ESR1二聚体:雌激素(核浆) ESR1二聚体:雌激素 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 9008257 2 E1, EST17b,雌三醇,酯[核质] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity 雌三醇(核浆) E1(核浆) estetrol(核浆) EST17b(核浆) Reactome //www.joaskin.com ChEBI 27974 ChEBI 17263 ChEBI 142773 ChEBI 16469 Reactome DB_ID: 9870318 2 UniProt: P06211 Esr1 鼠形 NCBI分类法 10116 UniProt P06211 链坐标 1 平等的 595 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9945448 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9945448 Reactome r -优化- 9008284 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-9008284.1 Reactome DB_ID: 9945450 1 TGFA基因幽灵同源物[核质] TGFA基因的Ghost同源物 Reactome数据库ID Release 77 9945452 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9945452 Reactome r -优化- 9008287 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-9008287.1 Reactome DB_ID: 9922337 2 UniProt: Q9EPU2 Ncoa3 UniProt Q9EPU2 1 平等的 1424 平等的 Reactome DB_ID: 9945454 1 ESR1:雌激素:之前:NCOA3: TFGA基因(核浆) ESR1:雌激素:之前:NCOA3: TFGA基因 Reactome DB_ID: 9945452 1 Reactome DB_ID: 9922337 2 1 平等的 1424 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9945454 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9945454 Reactome r -优化- 9008244 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-9008244.1 Reactome数据库ID Release 77 9945456 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9945456 Reactome r -优化- 9008258 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-9008258.1 x射线晶体学研究表明,配体结合的ESR1通过ESR1的c端配体结合结构域(LBD)与含LXXLL基序的NCOA3 (SRC3)相互作用,该结构域也具有配体依赖的反式激活功能(称为AF-2) (Brzozowski et al. 1997)。低温电子显微镜(cryo-EM)确定了dna结合ESR1、类固醇受体共激活剂3 (SRC3或NCOA3)和次级共激活剂(p300/EP300)的活性复合物的四元结构。结构模型表明该复合物的组装机制如下:两个配体结合的ESR1单体分别通过ESR1的反式激活域独立招募一个NCOA3蛋白;两个NCOA3又通过多次接触与一个p300蛋白的不同区域结合(Yi P et al. 2015)。 9338790 Pubmed 1997 雌激素受体激动和拮抗的分子基础 Brzozowski,米 派克,C 爱抚,Z 哈伯德,R E 波恩,T 阿,Engstrom 欧曼,我 格林,G L Gustafsson, J Carlquist, M 自然389:753-8 25728767 Pubmed 2015 DNA上具有生物活性的雌激素受体-辅激活复合物的结构 咦,平 王,Z 冯,秦 Pintilie Grigore D 福尔兹Charles E Lanz Rainer B Ludtke, Steven J 施密德,Michael F 赵,哇 奥马利,伯特W 细胞57:1047-58摩尔。 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构