从Reactome数据库中的“海藻糖生物合成”转换而来的BioPAX途径。
海藻糖生物合成
海藻糖生物合成
非还原性双糖海藻糖存在于昆虫、植物和微生物中。在细菌中,它是一种储存能量的来源,对许多应激条件下的生存至关重要。在分枝杆菌中,海藻糖也是细胞壁的一部分和对进入宿主很重要的“脐带因子”(Elbein等人,2003;Tropis等人,2005;Jain&Roy,2009)
结核分枝杆菌有三种合成海藻糖的方法:从UDP葡萄糖和磷酸葡萄糖(OtsAB途径),从麦芽糖(TreS途径),来自糖原(TreYZ途径)。OtsAB途径被证明是生物体所必需的。然而,尚不清楚海藻糖对分枝杆菌生长的重要性是否与细胞壁支原体的生物合成直接相关(De Smet et al,2000;Murphy et al,2005)
作者:Stephan, R, 2010-05-29
评论:华纳,D, 2010-11-25
编辑:Jassal, B, 2011-02-16
2.4.1.15
葡萄糖从udp -葡萄糖转移到葡萄糖-6-磷酸
葡萄糖从udp -葡萄糖转移到葡萄糖-6-磷酸
海藻糖磷酸合酶是一种四聚体(OtsA四聚体),催化葡萄糖从udp -葡萄糖(UDP-Glc)转移到葡萄糖-6-磷酸(G6P)形成α, α-海藻糖-6-磷酸(αα-T6P)。该酶受锰离子刺激,也可接受ADP-、CDP-、GDP-、tdp -葡萄糖和udp -葡萄糖(De Smet et al. 2000, Pan et al. 2008)。
作者:Stephan, R, 2010-05-29
评论:华纳,D, 2010-11-25
编辑:Jassal, B, 2011-02-16
Reactome DB_ID: 29410
1
胞质
去
0005829
UDP-D-glucose (ChEBI: 18066)
UDP-D-glucose
Reactome
//www.joaskin.com
ChEBI
18066
反应数据库ID:30537
1
α-D-葡萄糖6-磷酸(2-)[ChEBI:58225]
alpha-D-glucose 6-phosphate (2 -)
alpha-D-glucose 6-phosphate二阶阴离子
alpha-D-glucopyranose 6-phosphate
6-O-磷酸化α-D-吡喃葡萄糖
α-D-葡萄糖6-磷酸
ChEBI
58225
反应数据库ID:110096
1
UDP (ChEBI: 17659)
UDP
ChEBI
17659
Reactome DB_ID: 868701
1
α,alpha-trehalose 6-phosphate (ChEBI: 18283)
α,alpha-trehalose 6-phosphate
ChEBI
18283
Reactome DB_ID: 70106
1
海昌(ChEBI: 15378)
海昌
ChEBI
15378
生理学-从左到右
激活
反应数据库ID:868690
OtsA四聚物(胞质)
OtsA四聚体
Reactome DB_ID: 868641
4
UniProt: P9WN11 otsA
otsA
otsA
Rv3490
通过参与麦芽糖-1-磷酸(M1P)生物合成的TreS-Pep2分支产生糖原和α-葡聚糖的功能,以及可能通过海藻糖生物合成的渗透保护功能(PubMed:12473104,PubMed:27513637)。催化葡萄糖从UDP葡萄糖(UDP Glc)转移到D-葡萄糖6-磷酸(Glc-6-P)形成海藻糖6-磷酸(PubMed:12473104)。特异于葡糖基受体(Glc-6-P不能被甘露糖-6-P、果糖-6-P或葡糖胺-6-P替代),但任何葡萄糖核苷酸都可以用作葡糖基供体(PubMed:12473104)。嘌呤糖核苷酸比嘧啶糖核苷酸(PubMed:12473104)的活性更高。10 mM锰使活性调节活性增加约两倍。在10mM浓度下,ADP以UDP葡萄糖或GDP葡萄糖为底物抑制海藻糖-P的形成70%,但同样在10mM浓度下,GDP仅抑制与UDP葡萄糖(50%)的反应,而不抑制与GDP-葡萄糖的反应;海藻糖生物合成、亚单位同型四聚体、破坏表型glgM和ostA的联合失活是致命的,可能是由于ADP葡萄糖毒性水平的累积。otsA和glgC的联合失活导致α-葡聚糖和麦芽糖-1-磷酸(M1P)的损失。相似性属于糖基转移酶20家族。
结核分枝杆菌H37Rv
NCBI分类法
83332
UniProt
P9WN11
链坐标
1
平等的
500
平等的
结核分枝杆菌
NCBI分类法
1773
Reactome数据库ID Release 77
868690
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868690
Reactome
r - mtu - 868690
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868690.1
去
0003825
去分子功能
Reactome数据库ID Release 77
868707
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868707
Reactome数据库ID Release 77
868622
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868622
Reactome
R-MTU-8622
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868622.3
10658666
Pubmed
2000
分枝杆菌海藻糖生物合成的三条途径
德斯米特,卡
韦斯顿,
布朗,在
杨,DB
Robertson BD
微生物学146:199-208
12473104
Pubmed
2002
结核分枝杆菌的海藻糖磷酸合酶。重组酶的克隆、表达及性质
锅,欧美
卡罗尔,法学博士
Elbein,广告
欧洲生物化学杂志269:6091-100
3.1.3.12
海藻糖-6-磷酸被水解成海藻糖
海藻糖-6-磷酸被水解成海藻糖
OtsB2催化海藻糖磷酸水解得到海藻糖。这种酶需要镁来维持其活性。第二种同源物OtsB1是非功能性的(De Smet et al, 2000;Edavana等人,2004)。
作者:Stephan, R, 2010-05-29
评论:华纳,D, 2010-11-25
编辑:Jassal, B, 2011-02-16
Reactome DB_ID: 868701
1
Reactome DB_ID: 29356
1
水[ChEBI:15377]
水
ChEBI
15377
反应数据库ID:29372
1
hydrogenphosphate (ChEBI: 43474)
hydrogenphosphate
(警察丙(OH)) (2)
HYDROGENPHOSPHATE离子
磷酸氢
[P (OH) O3) (2)
HPO4(2-)
磷酸
无机磷酸盐基团
ChEBI
43474
Reactome DB_ID: 868614
1
α,alpha-trehalose (ChEBI: 16551)
α,alpha-trehalose
ChEBI
16551
生理学-从左到右
激活
Reactome DB_ID: 868623
OtsB-Mg2+[细胞溶胶]
OtsB-Mg2+
反应数据库ID:29926
1
镁(2+)[ChEBI:18420]
镁(2 +)
ChEBI
18420
Reactome DB_ID: 868661
1
UniProt: P9WFZ5 otsB
otsB
otsB
Rv3372
otsB2
从6-磷酸海藻糖中去除磷酸,产生游离海藻糖。活性调节被EDTA和钙抑制。当浓度达到100 ug/ml时,Diumycin和moenomycin刺激活性,然后在更高浓度时抑制活性。通路多糖生物合成;海藻糖生物合成。杂被确定为高可信度的药物靶点。属于海藻糖磷酸酶家族。
UniProt
P9WFZ5
1
平等的
391
平等的
Reactome数据库ID Release 77
868623
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868623
Reactome
R-MTU-8623
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868623.1
去
0004805
去分子功能
Reactome数据库ID Release 77
868627
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868627
Reactome数据库ID Release 77
868608
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868608
Reactome
r - mtu - 868608
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868608.2
15158675
Pubmed
2004
结核分枝杆菌海藻糖磷酸磷酸酶的克隆与表达:与耻垢分枝杆菌酶的比较
Edavana, VK
Pastuszak,我
卡罗尔,法学博士
Thampi P
亚伯拉罕,欧共体
Elbein,广告
Arch Biochem biophysics 426:250-7
5.4.99.16
麦芽糖转化为海藻糖
麦芽糖转化为海藻糖
麦芽糖转化为海藻糖。该反应中TRE的酶活性是反向反应的2-5倍(De Smet et al,2000)。
作者:Stephan, R, 2010-05-29
评论:华纳,D, 2010-11-25
编辑:Jassal, B, 2011-02-16
Reactome DB_ID: 868706
1
麦芽糖(ChEBI: 17306)
麦芽糖
ChEBI
17306
Reactome DB_ID: 868614
1
生理学-从左到右
激活
反应数据库ID:868682
UniProt: P9WQ19非常
特雷斯
特雷斯
Rv0126
功能催化麦芽糖和海藻糖的可逆转化(PubMed:18505459)。也显示淀粉酶活性,催化糖原(1->4)- α - d -葡萄糖苷键和麦芽糖七糖,产生麦芽糖,然后可以转化为海藻糖(PubMed:18505459)。TreS在利用海藻糖通过参与麦芽糖-1-磷酸(M1P)生物合成的TreS- pep2分支生产糖原和-葡聚糖中起着关键作用(PubMed:18505459, PubMed:27513637)。也可能作为细胞内海藻糖水平的传感器和/或调节器(PubMed:18505459)。因此,当细胞中的海藻糖水平达到危险的低水平时,TreS可以通过其淀粉酶活性加速糖原向麦芽糖的转化,进而将麦芽糖转化为海藻糖;但当细胞质海藻糖水平过高时,这种酶也可以加速或促进海藻糖向糖原的转化(PubMed:18505459)。通路多糖生物合成;糖原合成。通路胶囊生物起源;胶囊多糖生物合成。亚基Homohexamer。在小鼠中,缺乏该基因的细胞毒性与野生型细胞一样强,但也对细胞内和荚膜葡聚糖有深远影响(PubMed:20305657, PubMed:27513637)。 It is not possible to inactivate Rv3032 in a mutant lacking treS, suggesting the joint essentiality of the different alpha-(1->4)-glucans biosynthesis pathways involving these two genes (PubMed:20305657). Combined inactivation of glgM and treS results in absence of alpha-glucan (PubMed:27513637). Combined inactivation of treS and glgC results in absence of alpha-glucan content and is significantly attenuated for growth in the lung and spleen of BALB/C mice during both the acute and chronic phase of infection (PubMed:27513637).MISCELLANEOUS Was identified as a high-confidence drug target.MISCELLANEOUS Maltose-1-phosphate (M1P), the building block required for alpha-glucan production, is generated by two alternative routes: the TreS-Pep2 branch and the GlgC-GlgM branch, however it seems that TreS-Pep2 branch provides most of M1P for the GlgE pathway in M.tuberculosis.SIMILARITY Belongs to the glycosyl hydrolase 13 family. TreS subfamily.
UniProt
P9WQ19
去
0047471
去分子功能
Reactome数据库ID Release 77
868628
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868628
Reactome数据库ID Release 77
868709
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868709
Reactome
r - mtu - 868709
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868709.2
5.4.99.15
1,4- -葡聚糖转化为葡聚糖海藻糖
1,4- -葡聚糖转化为葡聚糖海藻糖
线性α-1,4-葡聚糖通过TreY酶在一端修饰为葡聚糖三卤糖(De Smet et al,2000)。
作者:Stephan, R, 2010-05-29
评论:华纳,D, 2010-11-25
编辑:Jassal, B, 2011-02-16
反应数据库ID:868686
1
(1 - > 4) -alpha-D-glucan (ChEBI: 15444)
(1 - > 4) -alpha-D-glucan
ChEBI
15444
Reactome DB_ID: 8960276
1
葡聚糖三海藻糖[ChEBI:134401]
glucanotrehalose
ChEBI
134401
生理学-从左到右
激活
Reactome DB_ID: 868619
UniProt:P9WQ21 treY
特雷
MTCY48.02
特雷
Rv1563c
功能:通过分子内转糖基化催化低糖麦芽糖转化为非还原糖,麦芽糖高糖基海藻糖(α -麦芽糖高糖基- d -葡萄糖苷)。亚基单体。属于糖基水解酶13家族。
UniProt
P9WQ21
1
平等的
765
平等的
去
0047470
去分子功能
Reactome数据库ID Release 77
868625
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868625
Reactome数据库ID Release 77
868658
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868658
Reactome
r - mtu - 868658
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868658.3
3.2.1.141
葡聚糖海藻糖水解为1,4- -葡聚糖和海藻糖
葡聚糖海藻糖水解为1,4- -葡聚糖和海藻糖
从葡聚糖海藻糖,酶TreZ切割一个海藻糖分子,留下一个线性葡聚糖比以前短了两糖。这是海藻糖生物合成TreYZ途径中的限速步骤(De Smet et al ., 2000)。
作者:Stephan, R, 2010-05-29
评论:华纳,D, 2010-11-25
编辑:Jassal, B, 2011-02-16
Reactome DB_ID: 8960276
1
Reactome DB_ID: 29356
1
Reactome DB_ID: 868632
1
Reactome DB_ID: 868614
1
生理学-从左到右
激活
Reactome DB_ID: 868672
UniProt: P9WQ23特雷
特雷兹
特雷兹
Rv1562c
MTCY48.03
功能参与海藻糖的生物合成,但不参与包膜葡聚糖和糖原的生物合成。通路多糖生物合成;海藻糖生物合成。treZ失活不影响荚膜- d -葡聚糖和糖原的产生。在BALB/c小鼠感染模型中,缺乏该基因的细胞的增殖或持久性不受影响。属于糖基水解酶13家族。
UniProt
P9WQ23
1
平等的
580
平等的
去
0033942
去分子功能
Reactome数据库ID Release 77
868635
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868635
Reactome数据库ID Release 77
868657
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868657
Reactome
r - mtu - 868657
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-868657.3
Reactome数据库ID Release 77
868688
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=868688
Reactome
R-MTU-8688
2
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MTU-8688.2
12626396
Pubmed
2003
海藻糖的新认识:一种多功能分子
Elbein,广告
锅,欧美
Pastuszak,我
卡罗尔,D
糖生物学13:17R-27R
15901732
Pubmed
2005
海藻糖和结构相关寡糖在棒状杆菌菌酸生物合成和转移中的关键作用
热带
Meniche X
狼,
格布哈特,H
Strelkov,年代
Chami, M
才,D
克莱默,R
Morbach,年代
Daffe, M
生物化学杂志280:26573-85
15703182
Pubmed
2005
OtsAB途径是结核分枝杆菌海藻糖生物合成的重要途径
墨菲,HN
斯图尔特,GR
Mischenko, VV
恰当的,
哈里斯,R
去,女士
德里斯科
杨,DB
Robertson BD
生物化学杂志280:14524-9
19177348
Pubmed
2009
海藻糖对蛋白质结构的影响
Jain, NK
罗伊,我
蛋白质Sci 18:24-36
去
0005992
生物过程