bioax途径由Reactome数据库中的“Biosynthesis of protectins”转化而来。 生物合成的保护 生物合成的保护 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 1.13.11.33 ALOX15氧化17(S)-Hp-DHA成PDX ALOX15氧化17(S)-Hp-DHA成PDX 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 29368 1 胞质 0005829 分子氧(ChEBI: 15379) 双氧 Reactome //www.joaskin.com ChEBI 15379 Reactome DB_ID: 9024012 1 z z z(4、7、10、13 z, 15个e, 17日,19 z) 17-hydroperoxydocosahexaenoic酸(ChEBI: 136113) z z z(4、7、10、13 z, 15个e, 17日,19 z) 17-hydroperoxydocosahexaenoic酸 ChEBI 136113 Reactome DB_ID: 9024883 1 (4 z, 7 z, 10, 11个e, 13个z, 15个e, 17日,19 z) -10年,17-dihydroxydocosahexaenoic酸(ChEBI: 138653) (4 z, 7 z, 10, 11个e, 13个z, 15个e, 17日,19 z) -10年,17-dihydroxydocosahexaenoic酸 ChEBI 138653 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10670513 ALOX15的同源物[胞质] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity ALOX15(胞质) 脂肪酶(胞质) 盘基网柄菌discoideum NCBI分类法 44689 UniProt Q86H96 UniProt Q54W35 0050473 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 10698235 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10698235 Reactome数据库ID Release 77 10698277 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10698277 Reactome r - ddi - 9024872 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DDI-9024872.1 15-脂氧合酶(ALOX15)可介导第二次脂氧合反应,其中17(S)-Hp-DHA被氧化生成保护素D1 (PD1)异构体PDX (Hong et al. 2003, Serhan et al. 2006, Chen et al. 2009)。PDX的化学结构为10(S),17(S)-二羟基二十二碳六- 4z,7Z,11E,13Z,15E, 19z -烯酸。它与PD1不同,具有E,Z,E几何构型(PDX)而不是E,E,Z (PD1),在碳10处具有S构型而不是R (Chen et al. 2009)。PDX不是白细胞的主要产物,与PD1相比,PDX作为多态核白细胞(PMN)浸润调节剂的效力较低(Serhan et al. 2006)。 19818771 Pubmed 2009 PDX的完整特性,神经保护素/保护素D1异构体,抑制血小板聚集 陈,P Fenet B 米肖德,年代 Tomczyk N Vericel E 拉加德,M Guichardant, M 2月。583:3478 - 84 12590139 Pubmed 2003 二十二碳六烯酸在小鼠脑、人血和神经胶质细胞中生成的新型二十二碳三烯和17S-resolvins。内分泌物在抗炎 在香港,歌 Gronert,卡斯滕 Devchand Pallavi R Moussignac, Rose-Laure Serhan,查尔斯·N 生物。化学278:14677 - 87 16424216 Pubmed 2006 神经保护素D1/保护素D1及其天然立体异构体的抗炎作用:含二羟基二十二碳三烯的赋值 Serhan,查尔斯·N Gotlinger凯瑟琳 在香港,歌 陆,Y Siegelman,杰弗里 贝尔,塔玛拉 杨,荣 科尔根,肖恩·P Petasis, Nicos j . Immunol 176:1848-59。 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 3.3.2.10 LTA4H:Zn2+水解16S, 17s环氧dha到(N)PD1 LTA4H:Zn2+水解16S, 17s环氧dha到(N)PD1 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 9024873 1 (16, 17 s)环氧- (4 z, 7 z, 10 z, 12 e, e, 14日19 z)二十二碳六烯酸(ChEBI: 140225) (16, 17 s)环氧- (4 z, 7 z, 10 z, 12 e, e, 14日19 z)二十二碳六烯酸 ChEBI 140225 Reactome DB_ID: 29356 1 水(ChEBI: 15377) ChEBI 15377 Reactome DB_ID: 9024886 1 保护D1 (ChEBI: 138655) 保护D1 ChEBI 138655 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 Reactome DB_ID: 10656629 LTA4H: Zn2 +(胞质) LTA4H: Zn2 + Reactome DB_ID: 29426 1 锌(2 +)(ChEBI: 29105) 锌(2 +) ChEBI 29105 Reactome DB_ID: 10656627 1 UniProt: P52922 lkhA UniProt P52922 链坐标 2 平等的 611 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10656629 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10656629 Reactome r - ddi - 266038 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DDI-266038.1 0004301 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 10698226 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10698226 Reactome数据库ID Release 77 10698281 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10698281 Reactome r - ddi - 9024890 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DDI-9024890.1 白三烯A4水解酶(LTA4H)是一种单体的可溶性酶,使用Zn2+辅助因子催化烯丙基环氧白三烯A4 (LTA4)的水解(McGee & Fitzpatrick 1985)。当它在神经组织中产生时,它能提供有效的组织保护作用,这种docsanoid被称为神经保护素D1 (NPD1)。 2995393 Pubmed 1985 白三烯A4的酶促水合作用。人红细胞环氧化物水解酶的纯化与表征 麦基J F•菲茨帕特里克 J Biol Chem 260:12832-7 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 1.13.11.33 ALOX15将17(R)-Hp-DHA脱氢为17R(16)-环氧- dha ALOX15将17(R)-Hp-DHA脱氢为17R(16)-环氧- dha 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 9024522 1 z z z(4、7、10、13 z, 15个e, 17个r, 19 z) 17-hydroperoxydocosahexaenoic酸(ChEBI: 138590) z z z(4、7、10、13 z, 15个e, 17个r, 19 z) 17-hydroperoxydocosahexaenoic酸 ChEBI 138590 Reactome DB_ID: 29366 1 辅酶ii (+) (ChEBI: 18009) 辅酶ii (+) ChEBI 18009 Reactome DB_ID: 29364 1 NADPH (ChEBI: 16474) NADPH TPNH ChEBI 16474 Reactome DB_ID: 9024893 1 17 r,(16)环氧- (4 z, 7 z, 10 z, 13 z, 19 z) -docosahexa-4、7、10、13、15日19-enoic酸(ChEBI: 140192) 17 r,(16)环氧- (4 z, 7 z, 10 z, 13 z, 19 z) -docosahexa-4、7、10、13、15日19-enoic酸 17 r, -epoxy-DHA (16) z z z(4、7、10、13 z) -15 - {(3 r) 3 - [(2 z) -pent-2-en-1-yl] oxiran-2-ylidene} pentadeca-4, 7日,10日13-tetraenoic酸 ChEBI 140192 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10670513 Reactome数据库ID Release 77 10698255 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10698255 Reactome r - ddi - 9020262 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DDI-9020262.1 二十二碳六烯酸(17(R)-Hp-DHA)的过氧化氢中间体经过15-脂氧合酶(ALOX15)的二次氢提取,形成中间体环氧17R(16)-环氧- dha (Serhan et al. 2011)。 21867913 Pubmed 2011 新型预分解阿司匹林触发的DHA通路 Serhan,查尔斯·N Fredman,加布里埃尔 杨,荣 Karamnov,谢尔盖 Belayev,柳德米拉年代 Bazan,尼古拉斯·G 朱、最小值 温克勒,杰里米·W Petasis, Nicos 化学。生物18:976 - 87 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 3.3.2.10 LTA4H:Zn2+水解17R(16)-环氧- dha到AT-(N)PD1 LTA4H:Zn2+水解17R(16)-环氧- dha到AT-(N)PD1 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 9024893 1 Reactome DB_ID: 29356 1 Reactome DB_ID: 9024879 1 阿司匹林触发protectin D1 [ChEBI:140202] aspirin-triggered保护D1 ChEBI 140202 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 Reactome DB_ID: 10656629 Reactome数据库ID Release 77 10698249 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10698249 Reactome r - ddi - 9020257 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DDI-9020257.1 白三烯A4水解酶(LTA4H)是一种单体的可溶性酶,使用Zn2+辅助因子催化烯丙基环氧白三烯A4 (LTA4)的水解(McGee & Fitzpatrick 1985)。LTA4H可能还能催化17R(6)-环氧二十二碳六烯酸(17R(16)-环氧二十二碳dha)水解为10(R),17(R)-二羟基二十二碳- 4z,7Z,11E,13E,15Z, 19z -六烯酸(阿司匹林触发(神经)保护素D1, AT-(N)PD1) (Serhan et al. 2011)。在人类细胞中,AT-(N)PD1降低了PMN的迁移,并通过巨噬细胞增强了凋亡的人PMN的渗出,表明AT-(N)PD1是一种有效的抗炎促分解分子(Serhan et al. 2011)。 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10702267 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10702267 Reactome r - ddi - 9018681 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DDI-9018681.1 0042759 生物过程 二十二碳六烯酸(DHA)是鱼油中发现的主要ω-3多不饱和脂肪酸(PUFA),是保护素(PDs)的来源,是一种特殊的促分解介质(SPMs),具有强大的抗炎和促分解作用(Molfino et al. 2017, Balas & Durand 2016)。通过15-脂加氧酶的诱导,从促炎二十烷类化合物的合成,如前列腺素和血栓素,转变为促分解脂素、溶解脂素和保护脂素。

Protectin,鉴定为(N)PD1 (N表示神经组织产生的神经保护素),由DHA经15-脂加氧酶作用后酶解而得。阿司匹林也可以触发表位保护素(AT-PD1)的形成(Serhan et al. 2015)。另外的保护素(DX)是通过两个脂氧合酶反应的顺序作用形成的。这里描述了这些保护素的生物合成(Balas & Durand 2016, Balas et al. 2014, Serhan et al. 2014, Serhan et al. 2015)。
28694914 Pubmed 2017 Omega-3多不饱和脂肪酸在危重疾病中的作用:抗炎、促分解还是两者兼而有之? Molfino,塞 阿玛比尔,玛丽亚艾达 蒙蒂,马西莫 Muscaritoli,莫里吉奥 Oxid Med Cell Longev 2017:5987082 25139562 Pubmed 2015 保护素和海藻素:在急性炎症和分解生物活性代谢组中新的促进分解的介质家族 Serhan,查尔斯·N 达利,Jesmond 可乐,罗曼 温克勒,杰里米·W 蒋介石,南 Biochim。Biophys。Acta 1851:397 - 413 24262603 Pubmed 2014 混淆protectin D1 (PD1)和它的异构体protectin DX (PDX)。综述了迄今为止所描述的二羟基二十二碳三烯 红晶石,劳伦斯 Guichardant,米歇尔 杜兰德专科学校,亨利 拉加德,米歇尔 Biochimie 99:1-7 25359497 Pubmed 2014 脂质介质在炎症解决中的作用 Serhan,查尔斯·N 蒋介石,南 达利,Jesmond Levy,布鲁斯维 冷泉Harb展望生物学7:a016311 26545300 Pubmed 2016 二羟E, E, Z-docosatrienes。综述了它们的合成及其生物学意义 红晶石,劳伦斯 杜兰德专科学校,亨利 掠夺。脂质61:1-18》 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构