bioax途径由Reactome数据库中的“角化”转化而来。 角化作用 角化作用 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 形成角落信封 形成角落信封 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

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关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Perp绑定Desmosomes. Perp绑定Desmosomes. 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

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关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 10631733 1 血浆膜 0005886. UNIPROT:G5ED30. vab-9. 反应 http://www.reacectome.org. Caenorhabditis elegans. NCBI分类法 6239 UniProt G5ED30 链坐标 1 平等的 193. 平等的 Reactome DB_ID: 10631747 1 细胞桥粒(质膜) DESMOSOME. Reactome DB_ID: 10586653 1 UNIPROT:Q19319 CDH-4. UniProt Q19319 50. 平等的 1049. 平等的 反应DB_ID:10629629 1 135 平等的 894. 平等的 反应DB_ID:10586297 1 UNIPROT:A0A1N7SYP3. vab-10 UniProt a0a1n7syp3. 1 平等的 2871 平等的 反应DB_ID:10586223 1 UNIPROT:Q9U308. Jac-1 UniProt Q9U308. 1 平等的 747. 平等的 从反垃圾中的EntitySet转换 Reactome DB_ID: 10617679 1 JUP的同源物[血浆膜] 从EnticeSet转换在反应中。每个同义词是身份有力的名称,每个XREF都指向一个身体性感性 HMP-2 [血浆膜] WRM-1 [血浆膜] Bar-1 [血浆膜] UniProt O44326 UniProt Q10953 UniProt Q18825 反应数据库ID版本77 10631747 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10631747 反应 r-cel-6814388 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CEL-6814388.1 Reactome DB_ID: 10631749 1 DESMOSOME:PERP [血浆膜] DESMOSOME:PERP. Reactome DB_ID: 10631747 1 Reactome DB_ID: 10631733 1 1 平等的 193. 平等的 反应数据库ID版本77 10631749 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10631749 反应 R-cel-8848046 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cel-8848046.1.1 反应数据库ID版本77 10631751 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10631751 反应 r -移动电话6814695 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cel -6814695.1.1 PERP(与PMP-22相关的p53效应体)是p53/p63靶基因,参与DNA损伤诱导的细胞凋亡(Flores et al. 2002)。它是一种四跨膜蛋白,与四跨膜蛋白claudin/PMP-22/EMP家族成员有远亲关系(Attardi et al. 2000)。在胚胎发生过程中,它具有上皮特异性表达模式,并定位于桥粒。Perp -/-敲除小鼠表现出大量的桥粒结构缺陷,表明Perp在促进桥粒粘附复合物的稳定组装方面发挥了作用(Ihrie et al. 2005)。 11932750. PubMed. 2002年 P53依赖性细胞凋亡需要P63和P73响应DNA损伤 Flores,Elsa R 蔡,肯尼斯·Y 克罗利,丹尼斯 Sengupta,Shomit. 杨,安妮 麦克斯顿,弗兰克 杰克,泰勒 自然416:560-4 15797384 PubMed. 2005年 Perp是一种对上皮完整性必需的p63调节基因 Ihrie,Rebecca a Marques,Michelle R. Nguyen,Bichau T 哈德尔,詹妮弗S Papazoglu,Cristian. 布朗森,罗伯克T 磨坊,Alea A Attardi,Laura D. 细胞120:843-56 10733530. PubMed. 2000年 Perp是p53的凋亡相关目标,是PMP-22 / Gas3家族的新型成员 Attardi,L D. reczek,e e Cosmas C Demicco E G McCurrach,M e 劳,S W 杰克,T. 基因开发。14:704-18 通过电子注释推断 IEA IEA 3.1.1.34 嘴唇水解Tg到DAG和RCOOH 嘴唇水解Tg到DAG和RCOOH 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 反应DB_ID:171126 1 细胞外区域 0005576 甘油三酸酯(ChEBI: 17855) 甘油三酯 Chebi. 17855 反应DB_ID:109276 1 水[Chebi:15377] Chebi. 15377 Reactome DB_ID: 174675 1 氨基甘油酯[Chebi:18035] 氨基甘油酯 Chebi. 18035 Reactome DB_ID: 6789319 1 羧酸[Chebi:33575] 羧酸 一种carboxilicos Carbonsaeuren. acide carboxylique RC(= O)哦 卡尔比诺雷 苹果盒羧基座 它是carboxilico Chebi. 33575 物理体左右 激活 从反垃圾中的EntitySet转换 反应DB_ID:10625106 角质形成细胞唇[细胞外区域] 从EnticeSet转换在反应中。每个同义词是身份有力的名称,每个XREF都指向一个身体性感性 lipl-7 [细胞外区域] lipl-2 [细胞外区域] Lipl-5 [细胞外区域] lipl-1(细胞外地区) lipl-4 [细胞外区域] Lipl-3 [细胞外区域] lipl-8(细胞外地区) lipl-8(细胞外地区) Lipl-5 [细胞外区域] lipl-8(细胞外地区) lipl-2 [细胞外区域] Lipl-6 [细胞外区域] lipl-1(细胞外地区) Lipl-6 [细胞外区域] Lipl-3 [细胞外区域] lipl-7 [细胞外区域] Lipl-3 [细胞外区域] lipl-4 [细胞外区域] Lipl-5 [细胞外区域] lipl-1(细胞外地区) lipl-2 [细胞外区域] Lipl-6 [细胞外区域] lipl-4 [细胞外区域] lipl-7 [细胞外区域] UniProt O17766 UniProt Q20449 UniProt O61866 UniProt Q93789. UniProt Q94252 UniProt O16956. UniProt Q9U276. UniProt E2S7J2 0004465 去分子功能 反应数据库ID版本77 10625107 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10625107 反应数据库ID版本77 10625109. 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10625109 反应 R-CEL-6789310 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CEL-6789310.1 脂肪酶是一种酶,水解膳食脂类,如脂肪、油和甘油三酯。人类的大多数脂肪酶是由胰腺分泌的,主要在消化系统中发挥作用。然而,脂肪酶成员K、M和N (LIPK, M和N)似乎都在角质细胞分化的最后一步发挥作用,在这一步中,它们被提议水解甘油三酯,释放对角膜炎水化至关重要的脂肪酸和甘油(Toulza et al. 2007)。 17562024 PubMed. 2007年 在表皮屏障功能中涉及人类基因的大规模鉴定 Toulza,夏娃 Mattiuzzo,Nicolas r Galliano,Marie-Florence Jonca,Nathalie. Dossat,Carole. 雅各,丹尼尔 De Daruvar,Antoine Wincker,Patrick. Serre,Guy Guerrin,滨海 基因组Biol。8:R107. 通过电子注释推断 IEA IEA 反应数据库ID版本77 10642934 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10642934 反应 r-cel-6809371 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cel-6809371.1 0070268 生物过程 随着角蛋白细胞朝向上表皮的进展,它们经历了一个独特的细胞死亡过程,称为康复(Eckhart等人2013)。这涉及通过细胞内和分泌的蛋白酶通过转谷氨酰胺酶和通过转谷蛋白酶和其他细胞细胞的破碎的角质形成细胞蛋白如植物细胞蛋白的交联(Eckhart等,2000,Denecker等,2008)。该过程受到表皮中的Ca2 +浓度梯度(Esholtz等,2014)的严格调节。鲁尔林林和有氯霉素在与编码CE的非还原成分的大量基因相关的“表皮分化复合物”中编码(Kypriotou等,2012,Niehues等,2016)。角质形成细胞产生专用蛋白质和脂质,用于构建颅骨状封套(Ce),一种赋予上表皮刚性的重交联的沉降层,使角蛋白长丝连接到细胞膜中的任何位置(Kirfel等,2003)并充当不透水的障碍。Ce具有两个功能部件:共价交联蛋白质(10nm厚),其包含包膜的骨架和涂覆外部的共价连接的脂质(5nm厚)(Eckert等人。2005)。将去染色体成分与Ce交联以形成玉米体染色物,其将颅骨细胞结合在一起(Ishida-Yamamoto等,2011)。成熟的终端分化的颅骨细胞主要由共价附着在植物中的CE中的角蛋白长丝组成(Kalinin等人2002)。角色包络的确切组成在上皮细胞之间变化(Steinert等人1998); the relative amino-acid composition of the proteins used may determine differential mechanical properties (Kartasova et al. 1996). 23792051 PubMed. 2013年 康复的细胞死亡 Eckhart,Leopold. Lippens,Saskia Tschachler,Erwin 拒绝,WIM Biochim。Biophys。Acta 1833:3471-80 12613658 PubMed. 2003年 角蛋白:具有出现功能的结构脚手架 柯尔福尔,J. 马夹,t m Reichelt,J. 细胞。摩尔。生活SCI。60:56-71 15737187. PubMed. 2005年 表皮谷氨酰胺转移酶的功能 Eckert,Richard L. Sturniolo,Michael T 布鲁姆,安玛丽 诡计,莫妮卡 Rorke,艾伦 j .投资。皮德罗尔。124:481-92 26556599 PubMed. 2016年 迟到的颅骨包膜(LCE)蛋白质:LCE2和LCE3成员的不同表达模式表明人体表皮和其他上皮中的非冗余作用 Niehues,H. van Vlijmen-Willems,我是J J Bergboer,J G M. Kersten,f f j 纳塔塔,M. Hendriks, W J A J van den bogaard,e h zeeuwen,p l J M Schalkwijk J 布尔。J. Dermatol。174:795-802 11121154 PubMed. 2000年 人角蛋白细胞和地层形成的末端分化与Caspase-14活化有关 Eckhart,L. DECHERCQ,W. 禁令,J. Rendl, M Lengauer,B Mayer,C. Lippens,S Vandenabeele,P Tschachler E j .投资。北京医学。115:1148-51 21545505. PubMed. 2011年 角质层细胞黏附的秩序和紊乱 Ishida-Yamamoto,厉害 井川庆,Satomi Kishibe,玛丽 J. Dermatol。38:645-54 15803139. PubMed. 2005年 角质包膜:皮肤中细胞死亡的模型 Candi,Eleonora. Schmidt,Rainer. Melino,格里 NAT。Rev. mol。细胞生物。6:328-40. 18250198 PubMed. 2008年 Caspase-14揭示了它的秘密 Denecker, Geertrui ovaere,佩特拉 Vandenabeele,P 拒绝,WIM J.细胞Biol。180:451-8 25514792 PubMed. 2014年 钙 - 健康与疾病中的角质形成细胞分化的中枢调节因子 Elsholz, Floriana Harteneck,Christian. 穆勒,沃尔特 弗里德兰,克里斯蒂娜 EUR J Dermatol 24:650-61 9565599. PubMed. 1998年 通过调节其角质细胞包络的生物力学性质,在上皮细胞包膜的生物力学性质中,生化证据 Steinert,p m 凯特阿娃娃,T. marekov,l n J. Biol。化学。273:11758-69 22507538 PubMed. 2012年 人体表皮分化复合物:角质包膜前体,S100蛋白和“融合基因” Kypriotou,Magdalini. Huber,Marcel. HOHL,D Exp。皮德罗尔。21:643-9 8601731. PubMed. 1996年 鼠标SPR1的序列和表达模式:上皮函数表达的相关性 凯特阿娃娃,T. Darwiche,N Kohno,Y. 小泉,H. Osada,年代 呵呵,n lichti,U. Steinert,p m Kuroki,T. j .投资。皮德罗尔。106:294-304 通过电子注释推断 IEA IEA 反应数据库ID版本77 10642936. 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10642936 反应 R-CEL-6805567 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cel -6805567.1 0031424 生物过程 角蛋白是脊椎动物表皮的主要结构蛋白,在完全分化的角质形成细胞中占85% (Fuchs 1995)。角蛋白属于中间丝(IF)蛋白超家族,形成α -螺旋螺旋二聚体,横向和端到端结合形成直径约10 nm的丝。角蛋白丝是异聚物,由等量的酸性I型角蛋白和碱性/中性2型角蛋白形成。人类有54个角蛋白基因(Schweitzer et al. 2006)。它们具有高度特异性的表达模式,与上皮类型和分化阶段有关。大约一半的人类角蛋白是毛囊特有的(Langbein & Schweizer 2005)。角蛋白丝束成张力丝,跨越细胞质并与桥粒和其他细胞膜结构结合(Waschke 2008)。这反映了它们的主要功能,维持单个细胞和上皮组织的机械稳定性(Moll et al. 2008)。 8689554 PubMed. 1995年 角蛋白和皮肤 福克斯,E 安努。rev. cell dev。BIOL。11:123-53 18386043 PubMed. 2008年 deamosome和pemphigus Waschke, Jens 组织。细胞生物。130:21-54 18461349. PubMed. 2008年 人类角蛋白:生物学和病理学 莫尔,罗兰 Divo,马库斯 Langbein,Lutz. 组织。细胞生物。129:705-33 16831889 PubMed. 2006年 哺乳动物角蛋白的新共识命名法 Schweizer,Jürgen. 鲍登,保罗e 库尔姆,Pierre a Langbein,Lutz. Lane,e Birgitte 裕度,托马斯·米 马耳他,Lois. Omary,M Bishr 大卫·A·D·帕里 罗杰斯,迈克尔 赖特,Mathew W J.细胞Biol。174:169-74 15797458 PubMed. 2005年 人毛囊的角蛋白 Langbein,Lutz. Schweizer,Jürgen. int。Rev. cytol。243:1-78 通过电子注释推断 IEA IEA