从“凝胶II络合物”转化的BIoPAX途径在反应数据库中转化为“凝结II络合物”。 凝血酶II复合物结合h4k20me1含核小体 凝血酶II复合物结合h4k20me1含核小体 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 10456527 1 骨髓 0005654. 凝结II [核质] Condensin二世 Reactome DB_ID: 10456521 1 UNIPROT:F1NWM5. ncapg2. 反应 //www.joaskin.com Gallus Gallus. NCBI分类法 9031. UniProt F1NWM5 链坐标 1 平等的 1143. 平等的 Reactome DB_ID: 10456525 1 UniProt: A0A3Q2U9L7 NCAPH2 UniProt A0A3Q2U9L7. 1 平等的 605. 平等的 反应DB_ID:10456509 1 SMC2的Ghost同源物[核质] SMC2的幽灵同源物 Reactome DB_ID: 10456513 1 UNIPROT:F1NDN4. SMC4 UniProt F1NDN4 1 平等的 1288. 平等的 Reactome DB_ID: 10456517 1 UniProt: F1NS98 ncapd3. UniProt F1NS98 1 平等的 1498. 平等的 反应数据库ID版本77 10456527 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10456527 反应 R-GGA-1638144 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-1638144.1 Reactome DB_ID: 10456534 1 H3K4ME2 / 3:H4K20ME1 [核质]的核体 核小体与H3K4me2/3: H4K20me1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10414138 2 组蛋白H2A(核浆) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity 从Reactome中的EntitySet转换而来 反应DB_ID:10411533 2 组蛋白H2B(核浆) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity Reactome DB_ID: 10456529 2 H3K4me2/3[核质]的Ghost同源物 H3K4me2/3的幽灵同源物 Reactome DB_ID: 10456532 2 UNIPROT:P62801 H4-I H4-I. H4-IV. H4-V. H4-III H4-I. H4-VI H4-VII H4-II 核心的功能核心组分。将核胚段包装和紧凑的DNA进入染色质,限制了对需要DNA作为模板的细胞机器的DNA可访问性。组蛋白从而在转录调节,DNA修复,DNA复制和染色体稳定性中起着核心作用。DNA可访问性通过组蛋白的复杂性翻译后修饰来调节,也称为组蛋白代码,核小体重塑。核小核心是含有两个分子的组蛋白八聚体,其中每种分子在一个H3-H4中组装在一个H3-H4中的H2A,H2B,H3和H4中的两个分子异质四聚体和两个H 2-H2B异二聚体。在Lys-6(H4K5Ac),Lys-9(H4K8Ac),Lys-13(H4K12ac)和Lys-17(H4K16Ac)中发生大约147bp的DNA.ptm乙酰化。在基因组的编码区域中,但不在异象酰胺中。PTM Citrullination at Arg-4 (H4R3ci) by PADI4 impairs methylation.PTM Monomethylation and asymmetric dimethylation at Arg-4 (H4R3me1 and H4R3me2a, respectively) by PRMT1 favors acetylation at Lys-9 (H4K8ac) and Lys-13 (H4K12ac). Demethylation is performed by JMJD6. Symmetric dimethylation on Arg-4 (H4R3me2s) by the PRDM1/PRMT5 complex may play a crucial role in the germ-cell lineage (By similarity).PTM Monomethylated, dimethylated or trimethylated at Lys-21 (H4K20me1, H4K20me2, H4K20me3). Monomethylation is performed by KMT5A/SET8. Trimethylation is performed by KMT5B and KMT5C and induces gene silencing. Monomethylated at Lys-13 (H4K12me1) by N6AMT1; H4K12me1 modification is present at the promoters of numerous genes encoding cell cycle regulators.PTM Phosphorylated by PAK2 at Ser-48 (H4S47ph). This phosphorylation increases the association of H3.3-H4 with the histone chaperone HIRA, thus promoting nucleosome assembly of H3.3-H4 and inhibiting nucleosome assembly of H3.1-H4 (By similarity).PTM Ubiquitinated by the CUL4-DDB-RBX1 complex in response to ultraviolet irradiation. This may weaken the interaction between histones and DNA and facilitate DNA accessibility to repair proteins. Monoubiquitinated at Lys-92 of histone H4 (H4K91ub1) in response to DNA damage. The exact role of H4K91ub1 in DNA damage response is still unclear but it may function as a licensing signal for additional histone H4 post-translational modifications such as H4 Lys-21 methylation (H4K20me) (By similarity).PTM Sumoylated, which is associated with transcriptional repression.PTM Butyrylation of histones marks active promoters and competes with histone acetylation.PTM Glutarylation at Lys-92 (H4K91glu) destabilizes nucleosomes by promoting dissociation of the H2A-H2B dimers from nucleosomes.PTM Ufmylated; monofmylated by UFL1 at Lys-32 (H4K31Ufm1) in response to DNA damage.PTM Lactylated in macrophages by EP300/P300 by using lactoyl-CoA directly derived from endogenous or exogenous lactate, leading to stimulates gene transcription.SIMILARITY Belongs to the histone H4 family. UniProt P62801 n6 -甲基-l -赖氨酸在21(在人类中) 21 平等的 N6-methyl-L-lysine (MOD: 00085) 2 平等的 103. 平等的 反应数据库ID版本77 10456534 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10456534 反应 r - gga - 2245190 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-245190.1 Reactome DB_ID: 10457110 1 浓缩蛋白II:含H4K20me1的核小体[核浆] Concensin II:H4K20ME1的核小体 Reactome DB_ID: 10456527 1 Reactome DB_ID: 10456534 1 反应数据库ID版本77 10457110 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10457110 反应 R-GGA-2288093 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-288093.1 反应数据库ID版本77 10457112 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10457112 反应 R-GGA-2288097 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-288097.1 单甲基化的组蛋白H4(H4K20ME1)的积累是在染色质中加载凝结素II络合物的累积所必需的。凝结II通过两种夹蛋白II亚基的热重复,NCAPD3和NCAPG2结合H4K20ME1(Liu等,2010)。至少部分地,要求RB1与染色质(Longworth等,2008)成功的Condensin II结合。然而,RB1在染色体上的组蛋白H4单甲基化和RB1促进的凝结II复合物之间的组蛋白H4单甲基化和RB1促进的载荷之间的确切作用。然而,在染色蛋白上的夹杂素II络合物之间的载体II络合物之间没有。然而,没有得到阐明。已知RB1系列蛋白质与H4K20三甲基化酶SCV4-20H1和SCV4-20H2相互作用,并在终端和端粒杂粒酰胺(Gonzalo等,2005)促进H4K20三甲基化。 18367646 PubMed. 2008年 RBF1通过与冷凝素II蛋白DCAP-D3的保守相互作用促进染色质缩合 Longworth,Michelle 先生, 记, Dyson,NJ. 基因开发22:1011-24 20622854. PubMed. 2010年 PHF8介导参与细胞周期进展的组蛋白H4赖氨酸20去甲基化事件 刘,W Tanasa,B Tyurina,机汇 周,泰 Gassmann R 刘,WT. Ohgi,卡 C·本纳 Garcia-Bassets,我 Aggarwal,正义与发展党 德赛, Dorrestein,电脑 玻璃,CK. 罗森菲尔德、镁 自然466:508-12 15750587 PubMed. 2005年 RB1家族在稳定组构异染色质组蛋白甲基化中的作用 Gonzalo,Susana García-cao,Marta 弗拉加,马里奥F Schotta,贡纳 安托万·彼得斯 开司特,谢谢 eguía,raúl 院长,道格拉斯州 Esteller,马奈尔· Jenuwein,托马斯 布拉斯科马 Nat,《细胞生物学》7:420-8 通过电子注释推断 IEA. IEA.