BioPAX途径由Reactome数据库中的“DSIF:NELF终止早期转录伸长”转化而来。 DSIF的预期终止早期转录伸长:NELF DSIF的预期终止早期转录伸长:NELF 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 反应DB_ID:10417143 1 骨髓 0005654 DSIF:nelf:早期伸长络合物[核质] DSIF: NELF:早期伸长复杂 Reactome DB_ID: 10417097 1 nelf复合物[核质] NELF复杂 Reactome DB_ID: 10417091 1 UNIPROT:Q5ZIQ8. NELFCD Reactome http://www.reacectome.org. 背带吊裤带 NCBI分类法 9031. UniProt Q5ZIQ8 链坐标 1 平等的 590 平等的 Reactome DB_ID: 10417083 1 UniProt: F1NCM6 NELFA UniProt F1ncm6. 1 平等的 528 平等的 Reactome DB_ID: 10417087 1 UniProt: Q5ZLK9 NELFB UniProt Q5ZLK9. 1 平等的 580. 平等的 Reactome DB_ID: 10417095 1 UniProt: A0A3Q2UGX9 NELFE UniProt A0A3Q2UGX9 1 平等的 380 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10417097 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10417097 Reactome R-GGA-112432 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-112432.1 反应DB_ID:10417141 1 与DSIF蛋白结合的RNA Pol II(低磷酸化)复合物[核质] RNA Pol II(低磷酸化)复合物与DSIF蛋白结合 反应DB_ID:10417103 1 DSIF复杂(核浆) DSIF复杂 反应DB_ID:10417101 1 UniProt: A0A3Q2TZR8 SUPT4H1 UniProt A0A3Q2TZR8 1 平等的 117 平等的 反应DB_ID:10415727 1 p-SUPT5H的幽灵同源物[核质] P-Supt5h的幽灵同源物 Reactome数据库ID Release 77 10417103 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10417103 Reactome r - gga - 112420 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-112420.1 反应DB_ID:10417139 1 RNA Pol II(低磷酸化):capped pre-mRNA complex[核浆] RNA Pol II(低磷酸化):帽前mrna复合体 Reactome DB_ID: 10412845 1 帽结合复合物(CBC)[核质] 盖结合复合物(CBC) Reactome DB_ID: 10412839 1 UNIPROT:F1NIR6. NCBP2. UniProt F1NIR6 1 平等的 156 平等的 Reactome DB_ID: 10412843 1 UniProt: Q5ZJZ6 NCBP1. UniProt Q5ZJZ6 1 平等的 790. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10412845 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10412845 Reactome R-GGA-77088 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-77088.1 反应DB_ID:10417107 1 UNIPROT:A0A3Q2U767. CTDP1 UniProt A0A3Q2U767. 1 平等的 961 平等的 反应DB_ID:10417137 1 RNA聚合酶II全酶复合物(低磷酸化):TFIIF复合物[核浆] RNA聚合酶II全酶复合物(低磷酸化):TFIIF复合物 Reactome DB_ID: 10412855 1 UniProt: A0A1D5PEI0 polr2i. UniProt A0A1D5PEI0 1 平等的 125 平等的 Reactome DB_ID: 10412851 1 UniProt: A0A1D5NWZ8 polr2j. UniProt A0A1D5NWZ8. 1 平等的 117 平等的 Reactome DB_ID: 10412881 1 UniProt: F1NHV9 polr2e. UniProt F1nhv9. 1 平等的 210. 平等的 Reactome DB_ID: 10412899 1 TFIIF(核浆) TFIIF. Reactome DB_ID: 10412897 1 UniProt: E1BXD0 GTF2F2 UniProt e1bxd0. 2 平等的 249 平等的 Reactome DB_ID: 10412893 1 GTF2F1 [核质]的幽灵同源物 GTF2F1的幽灵同源物 Reactome数据库ID Release 77 10412899 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10412899 Reactome r - gga - 109631 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga -109631.1 Reactome DB_ID: 10412865 1 POLR2G的幽灵同源物[核质] POLR2G的Ghost同源物 Reactome DB_ID: 10412873 1 UNIPROT:A0A3Q2TVW3. polr2h UniProt A0A3Q2TVW3. 2 平等的 150 平等的 Reactome DB_ID: 10412859 1 UNIPROT:F1NCB0. polr2b. UniProt F1ncb0. 1 平等的 1174 平等的 Reactome DB_ID: 10412877 1 UniProt: A0A1D5P7C5 polr2k. UniProt A0A1D5P7C5 1 平等的 58 平等的 Reactome DB_ID: 10412869 1 UniProt: E1BV97 polr2c. UniProt E1BV97 2 平等的 275 平等的 Reactome DB_ID: 10412885 1 UniProt: Q9PT88 RPB6 UniProt Q9PT88 2 平等的 127 平等的 Reactome DB_ID: 10412889 1 UNIPROT:E1BSY6. polr2l. UniProt E1BSY6 1 平等的 67 平等的 Reactome DB_ID: 10412847 1 p-s5 polr2a [n核质]的幽灵同源物 p-S5-POLR2A的Ghost同源物 Reactome DB_ID: 10412863 1 UniProt: F1P2S1 polr2d. UniProt F1P2S1 1 平等的 142 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10417137 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10417137 Reactome R-GGA-113427 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-113427.1 反应DB_ID:72085 1 pappe pre-mRNA [核质] 封顶pre-mRNA Reactome数据库ID Release 77 10417139. 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10417139 Reactome r - gga - 113715 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-113715.1 Reactome数据库ID Release 77 10417141. 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10417141 Reactome r - gga - 113406 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-113406.1 Reactome数据库ID Release 77 10417143 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10417143 Reactome r - gga - 113408 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾邮件中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-113408.1 反应DB_ID:10417143 1 Reactome数据库ID Release 77 10417246. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10417246 Reactome r - gga - 113409 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-113409.1 在早期延伸阶段,较短的转录本通常长度为30 nt,这是由于新生转录本的随机终止而产生的。这种终止的延伸主要是在与Pol II复合物结合的dsif - nef存在时观察到的。(Conaway等人,2000;希拉提法德等人,2003)。 10916156. Pubmed 2000 通过RNA聚合酶II控制伸长率。 Conaway,Joan W Shilatifard,A Dvir, Conaway,罗恩·C 趋势Biochem SCI 25:375-80 12676794 Pubmed 2003 RNA聚合酶II延伸复合物。 Shilatifard,A Conaway,罗恩·C Conaway,Joan W 安申Rev Biochem 72:693-715 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构