BioPAX途径由Reactome数据库中的“VHL:EloB,C:NEDD8-CUL2:RBX1复合物结合羟脯氨酸- hif - α”转化而来。 VHL:EloB,C:NEDD8-CUL2:RBX1复合物结合羟脯氨酸- hif - α VHL:EloB,C:NEDD8-CUL2:RBX1复合物结合羟脯氨酸- hif - α 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 10403425 1 胞质 0005829 RBX1: NEDD8-CUL2: EloB C: VHL: COMMDs: CCDC22: DCUN1D1, 2、4、5(胞质) RBX1: NEDD8-CUL2: EloB C: VHL: COMMDs: CCDC22: DCUN1D1, 2、4、5 Reactome DB_ID: 10402467 1 COMMDs: CCDC22(胞质) COMMDs: CCDC22 Reactome DB_ID: 10402437 1 UniProt: Q28G12 ccdc22 Reactome //www.joaskin.com 非洲爪蟾蜍tropicalis NCBI分类法 8364 UniProt Q28G12 链坐标 1 平等的 627 平等的 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10402465 1 COMMDs(胞质) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity Reactome数据库ID Release 77 10402467 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10402467 Reactome r -额外的8955646 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-8955646.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10403359 1 DCUN1D1, 2、4、5(胞质) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity Reactome DB_ID: 10358204 1 VBC复杂(胞质) VBC复杂 Reactome DB_ID: 10358196 1 UniProt: Q28H26 eloc UniProt Q28H26 1 平等的 112 平等的 Reactome DB_ID: 10358202 1 UniProt: A9ULN6 vhl UniProt A9ULN6 1 平等的 213 平等的 Reactome DB_ID: 10358198 1 UniProt: Q6P7Z2 elob UniProt Q6P7Z2 1 平等的 118 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10358204 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10358204 Reactome r - xtr - 390483 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-390483.1 Reactome DB_ID: 10357938 1 UniProt: A0A6I8S0I4 rbx1 UniProt A0A6I8S0I4 2 平等的 108 平等的 Reactome DB_ID: 10403367 1 NEDD8-CUL2(胞质) NEDD8-CUL2 Reactome DB_ID: 10403365 1 UniProt: Q28E73 nedd8 UniProt Q28E73 在76和689位点通过n6 -glycyl-赖氨酸进行链间交联(在智人中) 76 平等的 N6-glycyl-L-lysine ChEBI 30777 修改 1 平等的 76 平等的 Reactome DB_ID: 10403362 1 UniProt: A0A6I8R137 cul2 UniProt A0A6I8R137 689和76位点泛素化赖氨酸的链间交联(在智人中) 689 平等的 neddylated赖氨酸 ChEBI 24411 修改 1 平等的 745 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10403367 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10403367 Reactome r -额外的8952596 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-8952596.1 Reactome数据库ID Release 77 10403425 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10403425 Reactome r -额外的8956074 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-8956074.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10361329 1 hydroxyPro-HIF-alpha(胞质) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity hif1a(胞质) epas1(胞质) UniProt A0A6I8RYW3 UniProt F6VTD1 Reactome DB_ID: 10403435 1 RBX1: NEDD8-CUL2: EloB C: VHL: COMMDs: CCDC22: DCUN1D1, 2, 4, 5: hydroxyPro-HIF-alpha(胞质) RBX1: NEDD8-CUL2: EloB C: VHL: COMMDs: CCDC22: DCUN1D1, 2, 4, 5: hydroxyPro-HIF-alpha Reactome DB_ID: 10403425 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10361329 1 Reactome数据库ID Release 77 10403435 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10403435 Reactome r -额外的8956082 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-8956082.1 Reactome数据库ID Release 77 10403437 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10403437 Reactome r -额外的8956103 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-8956103.1 特征最明显的CRL2底物结合F-box蛋白是von Hippel- Lindau (VHL)肿瘤抑制因子,它以缺氧诱导因子(HIFalpha)的α亚基为靶点,通过VCP/p97和26s蛋白酶体进行泛素化和降解(Sufan和Ohh, 2006;Heir et al, 2013;review in Cai and Yang, 2016)。UBXN7是一种结合泛素化CUL2的接头,干扰CUL2:EloB:EloC:VHL E3泛素连接酶复合物泛素化HIF α的能力,以这种方式导致HIF α的积累(Bandau等,2012;Den Besten等人,2012) 12101228 Pubmed 2002 氧依赖的泛素化和缺氧诱导因子的降解需要von Hippel-Lindau肿瘤抑制蛋白的核细胞质转运 Groulx,我 李,年代 Mol Cell Biol 22:5319-36 10878807 Pubmed 2000 缺氧诱导因子的泛素化需要直接与von Hippel-Lindau蛋白的β结构域结合 哦,米 公园,连续波 伊凡,M 霍夫曼,马 金,泰 黄,勒 Pavletich N 洲,V Kaelin,工作组 Nat Cell Biol 2:423-7 11504942 Pubmed 2001 hif -1 α与VHL的结合是由刺激敏感的脯氨酸羟化调节的 Yu F 白色,某人 赵,问 Proc Natl academy Sci U S A 98:9630-5 9122164 Pubmed 1997 von Hippel-Lindau肿瘤抑制基因产物与人类CUL-2形成稳定的复合物,CUL-2是Cdc53蛋白家族的成员 暂停, 李,年代 Worrell,类风湿性关节炎 陈,DY 伯吉斯,WH Linehan, WM Klausner, RD 美国国立科学学院学报94:2156-61 12821933 Pubmed 2003 细胞核和细胞质定位在von Hippel-Lindau蛋白抑制肿瘤活性中的作用 刘易斯博士 罗伯茨,BJ 致癌基因22:3992-7 10823831 Pubmed 2000 缺氧诱导因子-结合和泛素化的von Hippel-Lindau肿瘤抑制蛋白 Cockman,我 马森,N 摩尔,博士 Jaakkola P 常,瓦 克利福德,SC 马赫,呃 普,连续波 拉特克利夫,PJ 麦克斯韦,PH值 J Biol Chem 275:25733-41 27222660 Pubmed 2016 基于Cullin 2的E3泛素连接酶的结构、调控及其生物学功能 Cai, Weijia 杨,海丰 细胞Div 11:7 11358837 Pubmed 2001 缺氧诱导因子-1与von Hippel-Lindau肿瘤抑制蛋白的动态位点特异性相互作用 Yu F 白色,某人 赵,问 癌症Res 61:4136-42 11024059 Pubmed 2001 von Hippel-Lindau肿瘤抑制蛋白外显子2编码β结构域的作用 Bonicalzi,我 Groulx,我 de Paulsen N 李,年代 J Biol Chem 276:1407-16 10944113 Pubmed 2000 肿瘤抑制蛋白调控缺氧诱导因子-1的机制 Tanimoto K 牧野,Y 佩雷拉,T Poellinger L EMBO J 19:4298 - 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