bioax途径由Reactome数据库中的“碳酸酐酶水合物二氧化碳(胞质)”转化而来。 4.2.1.1 碳酸酐酶水合物二氧化碳(Cytosol) 碳酸酐酶水合物二氧化碳(Cytosol) 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 113528 1 胞质 0005829 二氧化碳(ChEBI: 16526) 二氧化碳 反应 //www.joaskin.com ChEBI 16526 Reactome DB_ID: 29356 1 水(ChEBI: 15377) ChEBI 15377 Reactome DB_ID: 111627 1 hydrogencarbonate (ChEBI: 17544) 含水甘油酯 ChEBI 17544 Reactome DB_ID: 70106 1 海昌(ChEBI: 15378) 海昌 ChEBI 15378 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10364474 CA1、2、3、7、13:锌(胞质) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity 0004089 去分子功能 反应数据库ID版本77 10364475 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反应组:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10364475 反应数据库ID版本77 10364481 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10364481 反应 R-XTR-1475026 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-1475026.1 碳酸酐酶I (CA1,哈里发1971 Simonsson et al ., 1982年任和Lindskog 1992)、碳酸anyhydrase II(游离钙Tibell et al . 1984年,琼斯和肖1983年Pesando 1975年Ghannam et al . 1986年),碳酸酐酶III (CA3、卡特等。1979年,屠et al . 1990年,图et al . 1994,你等。1998年,西尔弗曼et al . 1993年),第七碳酸酐酶(CA7,Bootorabi et al. 2010, Gitto et al. 2010)水合物二氧化碳生成碳酸氢盐和质子。碳酸酐酶将水去质子化,生成锌-羟基和质子,并通过碳酸酐酶中的组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲分子。羟基与活性部位的二氧化碳反应生成碳酸氢盐。一个水分子取代了碳酸氢盐,反应循环再次开始(Lindskog 1997)。取决于反应物的浓度,反应是可逆的。
CA2和CA7具有较高的催化活性,CA1具有较低的催化活性(CA2活性的10%),CA3具有很低的催化活性(CA2活性的1%)。红细胞中存在CA1和CA2。在肾脏、肺和白色肌肉中也发现了CA2,在那里它有助于二氧化碳的扩散。CA3存在于红色肌肉中,参与抗氧化应激。
20578724 PubMed. 2010年 延长活性位点的结构和动力学研究,用于人碳酸酐酶II中的质子转移 DOMSIC,JF. 威廉姆斯,W 费舍尔,深圳 TU,C. agbandje-mckenna,m 西尔弗曼,DN 麦肯纳,R 生物化学49:6394-9 6407977 PubMed. 1983 常见的主要人体红细胞碳酸酐酶II,其次要组分和新的遗传变异,CA II墨尔本(237 Pro领导他)的化学和酶促比较 琼斯,GL 肖特区 哼麝猫63:392-9 120192 PubMed. 1979 骨骼肌中人碳酸酐酶III的表征 卡特,N 杰弗瑞,年代 Shiels, 爱德华兹,Y. Tipler T Hopkinson,Da 物化学麝猫17:837-54 1554744. PubMed. 1992 人碳酸酐酶I催化CO2水合的缓冲依赖性 任,X Lindskog,年代 生物物理学报1120:81-6 8399223 PubMed. 1993 人碳酸酐酶分子内质子转移的速率平衡关系III 西尔弗曼,DN TU,C. 陈,X. Tanhauser, SM 责任,AJ Laipis, PJ 生物化学32:10757 - 62 8083199 PubMed. 1994 活性位点残基的相互作用与人碳酸酐酶的催化活性III TU,C. 陈,X. 任,X LoGrasso,光伏 杰达 Laipis, PJ 西尔弗曼,DN J Biol Chem 269:23002-6 20493921. PubMed. 2010年 人碳酸酐酶VII在体外表达的缩短形式与全长酶的比较分析 Bootorabi F 詹尼斯·J 史密斯,E 他,一个 Kukkurainen,S Hytonen V Valjakka J Supuran, CT vullo,D. 狡猾的,威廉年代 Parkkila,年代 Biochimie 92:1072 - 80 3080418. PubMed. 1986 碳酸酐酶ii催化CO2水合反应的活化参数 Ghannam,房颤 Tsen W 罗莱特,RS J Biol Chem 261:1164-9 9635771. PubMed. 1998 碳酸酐酶III中分子内质子转移的性质 TU,C. 钱,米 伊斯兰德,JN. Laipis, PJ 西尔弗曼,DN Biophys J 74:3182-9 9336012 PubMed. 1997 碳酸酐酶的结构与机理 Lindskog,年代 杂志74:1-20 4994926 PubMed. 1971 碳酸酐酶的二氧化碳水化活性。I.天然人类同工酶B和C的止血动力学研究 哈里发,RG J Biol Chem 246:2561-73 2169869. PubMed. 1990 人碳酸酐酶催化质子转移的缓冲增强III 你,CK Paranawithana,老 杰达 Tanhauser, SM LoGrasso,光伏 Wynns,GC Laipis, PJ 西尔弗曼,DN 生物化学29:6400-5 6433979 PubMed. 1984 人碳酸酐酶II催化CO2水合的阴离子抑制。机械效力 Tibell L Forsman,C. Simonsson,我 Lindskog,年代 中国生物物理学报789:302-10 234739. PubMed. 1975 碳酸酐酶的质子磁共振研究。2群控催化活性 Pesando, JM 生物化学14:681-8 17427958 PubMed. 2007年 人碳酸酐酶III活性位点质子穿梭残基的结构和动力学分析 哥哥,我 费舍尔,Z Laipis, PJ TU,C. 麦肯纳,R 西尔弗曼,DN 蛋白质68:337-43 21282642 PubMed. 2011年 分子内的质子梭式不仅支持碳酸酐酶II的催化而且是非催化功能 贝克尔,嗯 Klier, M Schüler,C. 麦肯纳,R Deitmer, JW 美国国立科学学院学报108:3071-6 6819139 PubMed. 1982 人碳酸酐酶催化CO2/HCO-3交换的13C核磁共振研究I Simonsson,我 琼森,黑洞 Lindskog,年代 EUR J Biochem 129:165-9 20349499 PubMed. 2010年 鉴定有效和选择性人碳酸酐酶VII(HCA VII)抑制剂 Gitto,R. Agnello,S. 铁,年代 vullo,D. Supuran, CT Chimirri,A ChemMedChem 5:823-6 22001224 PubMed. 2011年 碳酸酐酶的结构和催化作用II:活性位点色氨酸的作用5 Mikulski,R DOMSIC,JF. 玲,G. TU,C. 罗宾斯,啊 西尔弗曼,DN 麦肯纳,R Arch Biochem Biophys 516:97-102 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构