BioPAX途径由Reactome数据库中的“AMP + H2O => IMP + NH4+ (AMPD)”转化而来。 3.5.4.6 Amp + h2o => imp + nh4 + (ampd) Amp + h2o => imp + nh4 + (ampd) 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 29356 1 胞质 0005829 水(ChEBI: 15377) Reactome //www.joaskin.com ChEBI 15377 Reactome DB_ID: 76577 1 腺苷5’一磷酸(ChEBI: 16027) 腺苷5’一磷酸 ChEBI 16027 Reactome DB_ID: 29602 1 IMP (ChEBI: 17202) 小鬼 5 '肌甙酸盐 肌苷一磷酸 肌苷5 '磷酸 肌苷5 '磷酸氢 5 '肌苷一磷酸 5 '肌苷酸 肌苷酸 ChEBI 17202 Reactome DB_ID: 31633 1 铵(ChEBI: 28938) ChEBI 28938 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10329418 AMPD四聚体(细胞溶质) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity 0003876 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 10329419 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10329419 Reactome数据库ID Release 77 10329421 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10329421 Reactome r - xtr - 76590 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-XTR-76590.1 胞质AMP脱氨酶(AMPD)催化AMP水解生成IMP和氨。AMPD的三种亚型,E, L和M,已经被确定,它们在体内的表达模式不同。然而,它们都以四聚体的形式出现,并且在性质上具有相同的催化活性(Bausch-Jurken et al. 1992;Mahnke-Zizelman et al. 1998)。 1429593 Pubmed 1992 AMP脱氨酶l亚型的分子克隆及人AMPD2 cDNA的细菌表达 Bausch-Jurken,太 Mahnke-Zizelman, DK Morisaki T 萨比娜,RL J Biol Chem 267:22407-13 9857047 Pubmed 1998 通过重组人AMP脱氨酶亚型的表达,揭示了四聚体组装和n端结构域和功能的新方面 Mahnke-Zizelman, DK Tullson,电脑 萨比娜,RL J Biol Chem 273:35118-25 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构