BioPAX途径由Reactome数据库中“添加+11和+30位点之间的核苷酸”转化而来。 2.7.7.6 在+11和+30位置之间添加核苷酸 在+11和+30位置之间添加核苷酸 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 从反垃圾中的EntitySet转换 Reactome DB_ID: 30595 1 核浆 0005654. 国家结核控制规划(核浆) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity UTP [核质] GTP [Nocleoplasm] ATP [核质] ctp [nocyoplasm] 反应 //www.joaskin.com ChEBI 15713 ChEBI 15996 ChEBI 30616 ChEBI 17677 反应DB_ID:10212191 1 含11个核苷酸长转录本的pol II转录复合物 Pol II转录络合物含有11个核苷酸长转录物 Reactome DB_ID: 10210274 1 TFIIH [核质] TFIIH 反应DB_ID:10210238 1 cak [nocleoplasm] CAK 反应DB_ID:10210236 1 UNIPROT:B8A5G8. MNAT1 Danio Rerio. NCBI分类学 7955 uniprot. B8A5G8. 链坐标 1 平等的 309 平等的 反应DB_ID:10210232 1 UNIPROT:A2BGI0. CCNH. uniprot. A2BGI0. 1 平等的 323 平等的 反应DB_ID:10210228 1 UNIPROT:Q2V6H0. cdk7 uniprot. Q2V6H0 1 平等的 346 平等的 反应数据库ID版本77 10210238. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10210238 反应 R-DRE-69221 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-69221.1 反应DB_ID:10210242 1 UNIPROT:F1Q5E7. ercc2 uniprot. F1Q5E7. 1 平等的 760. 平等的 反应DB_ID:10210246 1 UNIPROT:Q7ZVV1. ercc3 uniprot. Q7ZVV1. 1 平等的 782 平等的 反应DB_ID:10210268 1 UNIPROT:Q66I03 gtf2h1 uniprot. Q66I03. 1 平等的 548 平等的 反应DB_ID:10210260 1 UNIPROT:Q7ZVV4. gtf2h2. uniprot. Q7ZVV4. 1 平等的 395. 平等的 从反垃圾中的EntitySet转换 反应DB_ID:10210256 1 GTF2H3同源物[核质] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity gtf2h3(核浆) GTF2H3(核浆) uniprot. A5WWE3. uniprot. A0A2R8QHR5 Reactome DB_ID: 10210272 1 UNIPROT:Q5SNQ6. GTF2H5 uniprot. Q5SNQ6 1 平等的 71. 平等的 反应DB_ID:10210264 1 UniProt: A0A286YAJ0 gtf2h4. uniprot. A0A286YAJ0 1 平等的 462 平等的 反应数据库ID版本77 10210274 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10210274 反应 r - dre - 109634 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-109634.1 反应DB_ID:10208386 1 RNA聚合酶II(未磷酸化):TFIIF复合物[核浆] RNA聚合酶II(未磷酸化):TFIIF复合物 反应DB_ID:10208374 1 TFIIF [核质] TFIIF 反应DB_ID:10208368 1 UNIPROT:Q5PNQ6. gtf2f1 uniprot. Q5PNQ6 2 平等的 517. 平等的 反应DB_ID:10208372 1 UNIPROT:B8JHR3. gtf2f2a. uniprot. b8jhr3. 2 平等的 249. 平等的 反应数据库ID版本77 10208374. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10208374 反应 r - dre - 109631 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-109631.1 反应DB_ID:10208384 1 RNA聚合酶II全酶复合物(不磷酸化)[核质] RNA聚合酶II全酶复合物(未磷酸化) Reactome DB_ID: 10208346 1 UniProt: Q568H8 polr2h uniprot. Q568H8 2 平等的 150. 平等的 Reactome DB_ID: 10208326 1 UNIPROT:Q1LVK2. polr2i uniprot. Q1LVK2 1 平等的 125. 平等的 Reactome DB_ID: 10208350 1 UNIPROT:F1RDV9. polr2k uniprot. F1RDV9 1 平等的 58. 平等的 Reactome DB_ID: 10208334 1 UniProt: Q6DRG4 polr2d uniprot. Q6DRG4 1 平等的 142. 平等的 Reactome DB_ID: 10208342 1 UniProt: Q7ZV11 polr2c uniprot. Q7ZV11. 2 平等的 275. 平等的 反应DB_ID:10208354 1 UniProt: Q6DEG5 polr2eb. uniprot. Q6DEG5 1 平等的 210 平等的 反应DB_ID:10208382 1 UNIPROT:A0A0R4IMS9. polr2a uniprot. A0A0R4IMS9. 1 平等的 1970年 平等的 Reactome DB_ID: 10208338 1 UNIPROT:Q7ZW41. polr2g uniprot. Q7ZW41. 1 平等的 172. 平等的 Reactome DB_ID: 10208330 1 UNIPROT:A0A0R4IXL0. polr2b uniprot. a0a0r4ixl0. 1 平等的 1174. 平等的 Reactome DB_ID: 10208322 1 UNIPROT:Q4VBU5. polr2j uniprot. Q4VBU5 1 平等的 117. 平等的 反应DB_ID:10208358 1 UNIPROT:A0A2R8PUZ9. polr2f uniprot. A0A2R8PUZ9. 2 平等的 127. 平等的 反应DB_ID:10208362 1 UNIPROT:A5D6S6 polr2l uniprot. A5D6S6 1 平等的 67. 平等的 反应数据库ID版本77 10208384 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10208384 反应 R-DRE-113401 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-113401.1 反应数据库ID版本77 10208386 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10208386 反应 R-DRE-71307 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-71307.1 Reactome DB_ID: 75901 1 模板DNA:11核苷酸转录物杂种[核状] 模板DNA:11核苷酸转录杂种 反应数据库ID版本77 10212191 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212191 反应 R-DRE-75902 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-75902.1 Reactome DB_ID: 10212230 1 POL II转录络合物含有挤出转录物至+ 30 [核质] Pol II转录复合物包含挤压转录到+30 Reactome DB_ID: 10210274 1 反应DB_ID:10208386 1 反应DB_ID:111260 1 模板DNA:30 nt转录杂种[核质] 模板DNA: 30nt杂交转录本 反应数据库ID版本77 10212230 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id = 10212230 反应 r - dre - 157171 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾邮件中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-157171.1 Reactome DB_ID: 113541 1 diphosphoric酸(ChEBI: 29888) diphosphoric酸 ChEBI 29888 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 反应DB_ID:10208386 0003899 去分子功能 反应数据库ID版本77 10211618 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10211618 反应数据库ID版本77 10213549 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10213549 反应 R-DRE-111264 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-111264.1 当将新生转录物延伸至30-NT时,RNA聚合酶II转录复合物易于转录的转速和捕获。这种敏感性取决于下游DNA的存在,模板的特定DNA序列和转录因子的存在。转录因子TFIIH保持与RNA POL II伸长型络合物相关联,直到位置+30。在该阶段转录伸长因子TFII可以拯救停滞的转录伸长型复合物。转录泡尺寸在13-至22-nt之间变化。 11433015 PubMed. 2001年 伸长率早期RNA聚合酶II转录复合物的开放区域分析。 Fiedler,U. timmer, HT 核酸Res 29:2706-14 7601352 PubMed. 1995 RNA聚合酶II转录过程中一般转录因子的循环。 Zawel,L. Kumar,Kp. Reinberg,Danny. 基因Dev 9:1479 - 90 11486021. PubMed. 2001年 RNA聚合酶II的启动子间隙是延长的,多步骤,受序列受强烈影响的。 PAL,M. Mckean,D Luse,DS. Mol Cell Biol 21:5815-25 9353262 PubMed. 1997 启动子通过RNA聚合酶II逃逸。具有逃逸能力的转录中间体的形成是聚合酶从启动子中退出的先决条件。 DVIR,A 谭,斯 琼,Conaway W conaway,ron c J Biol Chem 272:28175-8 通过电子注释推断 IEA. IEA.