BioPAX途径由Reactome数据库中的“TNF:TNFR1:TRADD:TRAF2:RIPK1招募BIRC2/3 (cIAP1/2)”转化而来。 TNF:TNFR1:TRADD:TRAF2:RIPK1招募BIRC2/3 (cIAP1/2) TNF:TNFR1:TRADD:TRAF2:RIPK1招募BIRC2/3 (cIAP1/2) 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 10116026 1 等离子体膜 0005886 tnf: TNFR1: TRADD: RIPK1: TRAF2(质膜) tnf: TNFR1: TRADD: RIPK1: TRAF2 Reactome DB_ID: 10116014 3. 胞质 0005829 UniProt: A0A287BPE4 TRADD Reactome //www.joaskin.com 野猪 NCBI分类法 9823 UniProt A0A287BPE4 链坐标 1 平等的 312 平等的 Reactome DB_ID: 10116018 3. UniProt: F1RVZ4 TRAF2 UniProt F1RVZ4 2 平等的 501 平等的 Reactome DB_ID: 10116022 1 UniProt: A0A287BRT1 RIPK1 UniProt A0A287BRT1 1 平等的 671 平等的 Reactome DB_ID: 10116024 1 肿瘤坏死因子-三聚体的Ghost同源物:肿瘤坏死因子- r1三聚体[质膜] tnf - α三聚体的Ghost同源物:TNF-R1三聚体 Reactome数据库ID Release 77 10116026 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10116026 Reactome r - ssc - 140946 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SSC-140946.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10170958 1 BIRC2 3 4(胞质) 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity BIRC3(胞质) UniProt A0A287AZW3 Reactome DB_ID: 10170960 1 tnf: TNFR1: TRADD: RIP1: TRAF2: BIRC2/3(质膜) tnf: TNFR1: TRADD: RIP1: TRAF2: BIRC2/3 Reactome DB_ID: 10116026 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10170958 1 Reactome数据库ID Release 77 10170960 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10170960 Reactome r - ssc - 5357866 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SSC-5357866.1 Reactome数据库ID Release 77 10170988 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10170988 Reactome r - ssc - 5357780 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SSC-5357780.1 肿瘤坏死因子受体1 (TNFR1)的激活会刺激TNFR1、TNFR-associated via death domain (TRADD)、RIPK1、TNFR-associated factor 2 (TRAF2)和细胞凋亡抑制剂(BIRC2/3也称为cIAP1/2)组成的复合物的形成。发现TRAF2和BIRC (cIAP1)在溶液中形成复合物(Zheng et al. 2010),表明TNFR1:TRADD:RIPK1受体复合物招募TRAF2:BIRC复合物。在tnf - α刺激后,RIPK1在E3泛素连接酶(如BIRC2/3)的Lys377残基处迅速被k63泛素化,从而允许TAB2:TAK1复合物、LUBAC和IKK复合物的募集,最终刺激典型的NFkB激活。 20385093 Pubmed 2010 TRAF2: cIAP2和TRAF1: TRAF2: cIAP2配合物的晶体结构:亲和性、特异性和调控 郑,曹国伟 Kabaleeswaran, Venkataraman 王,亚亚 Cheng Genhong 吴,H 细胞38:101-13摩尔。 16282325 Pubmed 2006 cIAP1独特的BIR结构域介导了肿瘤坏死因子受体相关因子2和caspases的第二线粒体激活因子的结合和泛素化 撒母耳,Temesgen 威尔士,凯特 吊球,托马斯 多哥,Summanuna H 萨帕塔,胡安·米 里德C 生物。化学281:1080 - 90 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 激活 Reactome数据库ID Release 77 10170989 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10170989 Reactome DB_ID: 10170986 UniProt: F1SME2 TRAF1 UniProt F1SME2 1 平等的 416 平等的