从反应组数据库中的“RNA聚合酶I转录”转换而来的BioPAX途径。

RNA聚合酶I转录

这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

这一推断是基于黑豹的同源性映射。简言之，所有涉及的物理量（输入、输出和催化剂）都有一个映射的正态/旁态（对于络合物，至少75%的组分必须有一个映射）的反应被推断为其他物种。还为这些事件推断出高级事件，以便于导航。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp RNA聚合酶I启动子清除 RNA聚合酶I启动子清除这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp RNA聚合酶I启动子打开 RNA聚合酶I启动子打开这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp UBF-1结合rDNA启动子 UBF-1结合rDNA启动子这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 10049273 1. 核浆去 0005654 UniProt: F1MCZ7 UBTF 反应途径 //www.joaskin.com 黄牛分类学 9913 UniProt F1MCZ7 链坐标 1. 相等的 764 相等的反应数据库ID:73682 1. rDNA启动子[核质] rDNA启动子 Reactome DB_ID: 10049275 1. UBF-1: rDNA启动子(核浆) UBF-1: rDNA启动子 Reactome DB_ID: 10049273 1. 1. 相等的 764 相等的反应数据库ID:73682 1. Reactome数据库ID版本77 10049275 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049275 反应途径 R-BTA-73684 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73684.1 Reactome数据库ID版本77 10049532 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049532 反应途径 r - bta - 73718 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73718.1 UBF-1直接与核糖体DNA启动子的核心和UCE元件结合。这种结合由HMG盒（主要是HMG盒1）介导。磷酸化可能在调节UBF的DNA结合活性以及后续步骤中发挥作用。UBF被认为是以构象特异性方式（与序列特异性方式相反）结合DNA。UBF与DNA小沟的结合引起DNA的强烈弯曲。 2330041 Pubmed 1990 核仁转录因子hUBF含有一个与HMG蛋白同源的dna结合基序。示,嗯贝尔,SP 特健，R 自然344:830-6 电子注释推断国际能源署去国际能源署抑制 Reactome数据库ID版本77 10049533 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049533 Reactome DB_ID: 10049509 核小体(核浆) 核小体从Reactome中的EntitySet转换而来反应数据库ID:10049496 2. 组蛋白H2B[核浆] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称，每个XREF指向一个PhysicalEntity 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10049327 2. 组蛋白H2A[核浆] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称，每个XREF指向一个PhysicalEntity 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10049507 2. 组蛋白H3[核浆] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称，每个XREF指向一个PhysicalEntity HIST2H3A(核浆) H3-3B(核浆) HIST1H3A(核浆) UniProt 第84227页 UniProt Q5E9F8 UniProt P68432 从Reactome中的EntitySet转换而来反应数据库ID:10049282 2. HIST1H4同源物[核质] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称，每个XREF指向一个PhysicalEntity LOC107131556[核质] 组蛋白H4(核浆) UniProt A0A3Q1LMV7 UniProt P62803 Reactome数据库ID版本77 10049509 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049509 反应途径 R-BTA-427402 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-427402.1 抑制 Reactome数据库ID版本77 10049534 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049534 Reactome DB_ID: 10049530 染色质(H3K9me2, 5mC):MBD2[核质] 染色质(H3K9me2 5 mc): MBD2 Reactome DB_ID: 10049528 1. 含H3K9me2，5mC的染色质[核质] 染色质含H3K9me2，5mC 反应数据库ID:212172 1. 含5-mC的DNA[核质] DNA含有5-mC DNA甲基化含5-甲基胞嘧啶的双链DNA Reactome DB_ID: 10049526 1. 含H3K9me2的核小体含H3K9me2的核小体从Reactome中的EntitySet转换而来反应数据库ID:10049496 2. 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10049327 2. 从Reactome中的EntitySet转换而来反应数据库ID:10049282 2. 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10049524 2. 组蛋白H3在赖氨酸-9处二甲基化[核浆] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称，每个XREF指向一个PhysicalEntity Me2K10-HIST1H3A(核浆) H3-3B(核浆) Me2K-10-HIST2H3A[核质] Reactome数据库ID版本77 10049526 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049526 反应途径 r - bta - 427331 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-427331.1 Reactome数据库ID版本77 10049528 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049528 反应途径 R-BTA-5226877 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-5226877.1 Reactome DB_ID: 10049513 1. UniProt:G5E683 MBD2 UniProt G5E683 1. 相等的 411 相等的 Reactome数据库ID版本77 10049530 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049530 反应途径 r - bta - 427343 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-427343.1 Reactome数据库ID版本77 10107090 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10107090 反应途径 r - bta - 73728 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73728.1 去 0006361 GO生物过程上游结合因子（UBF-1）的活性在调节rRNA合成中起重要作用。研究表明，UBF-1的磷酸化是其与RNA聚合酶I复合物相互作用所必需的，这表明在启动子打开期间UBF-1与rDNA启动子结合的磷酸化调节转录起始复合物的组装。电子注释推断国际能源署去国际能源署 RNA聚合酶I转录起始 RNA聚合酶I转录起始这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp RRN3与RNA聚合酶I的结合 RRN3与RNA聚合酶I的结合这一事件是从另一个物种中证明的事件计算推断出来的。

http://www.pantherdb.org/about.jsp“target='NEW'>http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 10049571 1. RNA聚合酶I全酶[核质] RNA聚合酶I全酶 Reactome DB_ID: 10049545 1. POLR1D的Ghost同源物[核质] POLR1D的幽灵同系物反应数据库ID:10048491 1. POLR2F的Ghost同源物[核质] POLR2F的鬼同系物 Reactome DB_ID: 10048487 1. UniProt: Q3ZBC0 POLR2K UniProt Q3ZBC0 1. 相等的 58 相等的 Reactome DB_ID: 10049549 1. UniProt:Q32L22 POLR1C UniProt Q32L22 2. 相等的 346 相等的反应数据库ID:10048495 1. UniProt:Q32P78 POLR2L UniProt Q32P78 1. 相等的 67 相等的 Reactome DB_ID: 10049569 1. UniProt:Q1RMP0 POLR1H UniProt Q1RMP0 1. 相等的 126 相等的 Reactome DB_ID: 10049561 1. UniProt:Q3SZ29 POLR1E UniProt Q3SZ29 1. 相等的 481 相等的 Reactome DB_ID: 10049553 1. UniProt: E1BIX2 POLR1A UniProt E1BIX2 1. 相等的 1720 相等的 Reactome DB_ID: 10049565 1. UniProt: A7YWA1 POLR1F UniProt A7YWA1 1. 相等的 338 相等的 Reactome DB_ID: 10048483 1. UniProt: F2Z4H3 POLR2H UniProt F2Z4H3 2. 相等的 150 相等的 Reactome DB_ID: 10048489 1. POLR2E[核质]的幽灵同系物 POLR2E的鬼同系物 Reactome DB_ID: 10049543 1. UniProt: A6QLS0 POLR1B UniProt A6QLS0 1. 相等的 1135 相等的 Reactome DB_ID: 10049557 1. UniProt:F6QVL1 POLR1G UniProt F6QVL1 1. 相等的 510 相等的 Reactome数据库ID版本77 10049571 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049571 反应途径 r - bta - 73859 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73859.1 Reactome DB_ID: 10049575 1. UniProt: E1B883 RRN3 UniProt E1B883 1. 相等的 651 相等的 Reactome DB_ID: 10049577 1. 活性RNA聚合酶I 活性RNA聚合酶I Reactome DB_ID: 10049571 1. Reactome DB_ID: 10049575 1. 1. 相等的 651 相等的 Reactome数据库ID版本77 10049577 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049577 反应途径 r - bta - 73715 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73715.1 Reactome数据库ID版本77 10049579 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10049579 反应途径 r - bta - 73757 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73757.1 RNA聚合酶I全酶组装后，Rrn3结合发生(Engel et al. 2016, Pilsl et al. 2016)。 27418309 Pubmed 2016 4.8 Å分辨率的RNA聚合酶I-Rrn3复合物恩格尔,克里斯托弗普利茨科，尤尔根克莱默，P 纳特公社7:12129 27418187 Pubmed 2016 起始活性RNA聚合酶I的结构及其转录意义 Pilsl,迈克尔十字架，科琳 Papai,伽柏克虏伯，费迪南德斯坦鲍尔,罗伯特 Griesenbeck,约阿希姆 Milkereit,菲利普 Tschochner,赫伯特舒尔茨,帕特里克。纳特公社7:12126 电子注释推断国际能源署去国际能源署 Reactome数据库ID版本77 10107096 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10107096 反应途径 r - bta - 73762 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73762.1 在起始阶段，双链DNA必须被熔化，转录开始。SL1与UBF-1和rDNA启动子形成并相互作用。正是这个平台将激活的RNA聚合酶I募集到SL1:磷酸化的UBF-1:rDNA启动子复合物。

哺乳动物rRNA基因之前有一个被SL1复合体识别的终止元件。SL1调控Pol I基础转录机制的乙酰化具有功能性结果，表明可逆的乙酰化可能是调控rDNA转录的一种方式。电子注释推断国际能源署去国际能源署 Reactome数据库ID版本77 10107092 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10107092 反应途径 r - bta - 73854 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73854.1 启动子清除是聚合酶I转录的限速步骤之一。这一步骤由启动子打开、转录起始和启动子逃逸三个阶段组成。 14969726 Pubmed 2004 RNA聚合酶I的转录机制 Comai,卢西奥高级蛋白质化学。67:123-55 电子注释推断国际能源署去国际能源署 Reactome数据库ID版本77 10107094 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10107094 反应途径 r - bta - 73864 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-BTA-73864.1 去 0006360 GO生物过程 RNA聚合酶(Pol) I(三种真核核RNA聚合酶之一)致力于核糖体DNA基因的转录，这些基因在每个真核细胞中都有多个排列副本。这些基因编码大核糖体RNA前体，然后加工成核糖体RNA的三个最大亚基，18S、28S和5.8S RNA。在人类细胞中，rDNA基因簇位于五对端中心染色体的短臂上。rRNA启动子有两个基本的、特别间隔的序列:一个核心元件和一个上游控制元件(UCE，也称为UPE)。人类启动子的CORE元件与转录起始位点重叠，从20延伸到45，是特异性转录起始所必需的。聚合酶是一个多亚基复合体，由两个大亚基(最保守的部分包括与其他真核生物和细菌多亚基RNA聚合酶相似的催化位点)和一些较小的亚基组成。在许多实验条件下，核心能够介导核糖核酸的合成，然而在体内，它需要额外的因素来选择合适的模板。人类的RNA转录本(45S)大约有13000个核苷酸长。在作为核糖体粒子离开细胞核之前，45S rRNA被切割，得到28S rRNA、18S rRNA和5.8S rRNA各一份。将这三种rrna转录为一个转录本，就会产生等量的rrna。电子注释推断国际能源署去国际能源署